文献类型：期刊文献

中文题名：中间锦鸡儿FAD2基因拷贝数检测及组织表达谱分析

英文题名：Copy detection and expression profile analysis of FAD2 genes in Caragana intermedia

作者：林萍[1] 汪阳东[1] 齐力旺[2] 张守攻[2]

第一作者：林萍

机构：[1]中国林业科学研究院亚热带林业研究所;[2]中国林业科学研究院林业研究所

年份：2010

期号：1

起止页码：119-124

中文期刊名：西北农林科技大学学报：自然科学版

收录：CSTPCD;;北大核心:【北大核心2008】；CSCD:【CSCD2011_2012】；

基金：国家"十一五"科技支撑专题(2006BAD01A1606)

语种：中文

中文关键词：中间锦鸡儿;FAD2基因;实时定量PCR;表达谱

外文关键词：Caragana intermedia; FAD2 gene; Real-time PCR; expression profile;

分类号：S793.3

摘要：【目的】探索中间锦鸡儿基因组中FAD2基因的拷贝数,分析不同拷贝的表达模式,以期揭示不同拷贝在植物体内的功能分工。【方法】根据中间锦鸡儿(Caragana intermedia)FAD2基因的保守序列设计1对引物SF和SR,利用该引物对PCR扩增制备114 bp的Southern检测探针,探针进行地高辛标记后,采用罗氏Southern杂交试剂盒进行Southern检测。根据中间锦鸡儿3个FAD2基因各自的特异差异序列,分别设计定量PCR引物序列,以actin基因为内参,对中间锦鸡儿的根、茎、叶及不同发育时期(发芽15,25,35 d)种子的cDNA进行定量PCR分析。【结果】中间锦鸡儿FAD2基因至少有4个拷贝,且不同拷贝的表达模式不同。FAD2-2A基因在根和发育中期、后期的种子中低水平表达,在幼嫩的茎、叶以及发育早期的种子中高水平表达;FAD2-1A基因在根中的表达量最低,在种子发育早期、中期大量表达,在幼嫩叶子中表达水平也较高;FAD2-1B基因仅在种子发育中期大量表达,在其他组织及种子其他发育阶段的表达量均保持在本底水平。在不同组织以及种子的不同发育时期,FAD2-1A相对表达量的变化幅度最大,达到了近100倍,FAD2-1B次之,FAD2-2A最小。【结论】结合序列比对分析推测:FAD2-2A基因可能主要负责合成膜脂中的亚油酸,FAD2-1A主要负责种子及叶子贮脂中亚油酸的合成,FAD2-1B负责种子贮脂中油酸的去饱和作用。
【Objective】 The study was to detect the FAD2 gene copies,analyze the FAD2 gene expression profile and presume every copy s function in Caragana intermedia.【Method】 The Southern-blotting probe was prepared by PCR with the primers designed according to the consensus sequence of FAD2 genes in C.intermedia.The probe was labeled by digoxin and Southern-blotting was done with Roche Southern-blotting kit.The real-time PCR primers were designed according to the distinct sequences of every FAD2 copy.The quantity PCR...