文献类型：专利

中文题名：基于全基因组数据开发的松阿扁叶蜂微卫星引物及其应用

作者：王梅[1] 刘梦飞[1] 王小艺[1] 王鸿斌[1] 李国宏[1] 韩丽[1] 王晓娟[1]

第一作者：王梅

机构：[1]中国林业科学研究院森林生态环境与自然保护研究所(国家林业和草原局世界自然遗产保护研究中心);

专利类型：发明专利

申请号：CN202311544333.6

申请日：20231120

申请人地址：100091 北京市海淀区东小府2号

公开日：20240112

代理人：李镇

代理机构：北京一枝笔知识产权代理事务所(普通合伙)

语种：中文

中文关键词：松阿扁叶蜂;微卫星引物;全基因组;种群;微卫星标记引物;高通量测序;基因组序列;微卫星标记;微卫星位点;动态演化;独立分开;二核苷酸;个体水平;扩增效率;软件设计;手动筛选;数据开发;遗传标记;遗传机制;种群水平;重复基序;多态性;分辨率;虫害;开发;位点;引物;筛选;验证;研究;应用

年份：2024

摘要：本发明提供了基于全基因组数据开发的松阿扁叶蜂微卫星引物及其应用，涉及全基因组微卫星标记开发技术领域。所述松阿扁叶蜂微卫星引物包括79对。本发明利用高通量测序测得松阿扁叶蜂随机基因组序列，从中分离得到93,876个完美微卫星位点，共有256种重复基序，其中单、二核苷酸位点最为丰富。经QDD3软件设计引物、严格的手动筛选、个体水平的筛选和种群水平的验证，开发得到79对扩增效率高、多态性较好和分辨率高的微卫星标记引物，能够将山东和黑龙江两个种群的个体独立分开。本研究开发的79对微卫星引物，将为松阿扁叶蜂的种群研究提供有效的遗传标记，以揭示其动态演化历史和虫害爆发的遗传机制。