文献类型：期刊文献

中文题名：杨树SAMT基因的克隆及生物信息学分析

英文题名：Cloning and Bioinformatics Analysis of SAMT Gene of Poplar

作者：董慧霞[1,2] 孟繁丽[1,4] 陈军[3] 理永霞[1,4]

第一作者：董慧霞

机构：[1]中国林业科学研究院林业新技术研究所,北京100091;[2]河南师范大学生命科学学院,新乡453007;[3]南京林业大学南方现代林业协同创新中心,凤城118100;[4]辽宁省凤城市林业有害生物防治检疫局

年份：2020

卷号：18

期号：15

起止页码：4936-4942

中文期刊名：分子植物育种

外文期刊名：Molecular Plant Breeding

收录：CSTPCD;;北大核心:【北大核心2017】；CSCD:【CSCD_E2019_2020】；

基金：国家重点研发计划(2017YFD0600102)资助。

语种：中文

中文关键词：‘84K杨’;SAMT基因;生物信息学分析

外文关键词：‘Poplar 84K';SAMT gene;Bioinformatics analysis

分类号：S792.11

摘要：为了揭示水杨酸甲酯转移酶SAMT (Salicylic acid carboxyl methyltransferase)基因在杨树抗溃疡病中的功能。本研究采用RT-PCR技术和pGM-T克隆的方法,获得了‘84K杨’的SAMT基因序列,并对该基因编码的蛋白的理化性质、疏水性、结构域、功能、二级结构及亚细胞定位等进行了生物信息学分析。结果显示:该基因位于细胞质中,属于甲基转移酶7家族,为亲水性蛋白。预测结果为下一步研究该基因在杨树抗溃疡病中的功能提供了帮助,也为其在其他多年生木本植物中的功能研究提供了参考。
In order to reveal the function of methyl salicylate transferase SAMT(Salicylic acid carboxyl methyltransferrase) gene in poplar anti-ulcerative disease.The SAMT gene sequence of ’Poplar 84 K’ was obtained by RT-PCR and p GM-T cloning.Meanwhile,the physicochemical properties,hydrophobicity,domain,function,secondary structure and subcellular localization of the protein encoded by the gene were obtained by bioinformatics analysis.The results showed that the gene was located in the cytoplasm and belonged to the methyltransferase 7 family,which was a hydrophilic protein.The prediction results provide a basis for the further study of the function of the SAMT gene in poplar canker resistant and also provide a reference for its functional studies in other perennial woody plants.