文献类型：会议论文

中文题名：日本落叶松咖啡酸-O-甲基转移酶基因LKCOMT的克隆及单核苷酸多态性分析

作者：易敏[1] 张守攻[1] 谢允慧[1] 孙晓梅[1]

第一作者：易敏

机构：[1]林木遗传育种国家重点实验室,中国林业科学研究院林业研究所,北京,100091;

会议日期：2013年10月1日

会议地点：长沙

主办单位：中国林学会林木遗传育种分会

语种：中文

中文关键词：日本落叶松;咖啡酸-O-甲基转移酶基因;基因克隆;单核苷酸多态性

分类号：TP3;S79

年份：2013

摘要：　　依据日本落叶松转录组数据库检测到的咖啡酸-O-甲基转移酶(COMT)基因ESTS序列设计引物,分离得到一个编码该酶的新基因.其CDNA克隆全长为1 350 BP,包含长度为1 092 BP的开放阅读框,可编码364个氨基酸残基.序列分析显示,所推导的蛋白质氨基酸序列包含COMT基因5个所特有的保守元件,与海岸松PPCOMT的蛋白质氨基酸序列同源性达94％.在此基础上,利用DNASP5.0软件对日本落叶松40株基因型个体的LKCOMT序列进行了单核苷酸多样性SNPS分析,共检测到92个SNP位点,SNP发生频率为1/17 BP,多样性指数πT为0.007 80.在这些SNPS中,65个属于转换,27个属于颠换.在外显子区域,共检测到58个SNP位点,其中37个为错义突变,21个为同义突变.研究结果为日本落叶松基因标记辅助育种提供了理论基础.