详细信息
文献类型:期刊文献
中文题名:杨树PIF基因家族成员表达模式研究
英文题名:Analysis of Expression Pattern of PIF Family Members in Populus
作者:徐向东[1] 任逸秋[1,2] 张利[3] 李煜[1] 王丽娟[1] 卢孟柱[1]
第一作者:徐向东
机构:[1]林木遗传育种国家重点实验室国家林业局林木培育重点实验室中国林业科学研究院林业研究所;[2]西北农林科技大学林学院;[3]菏泽学院园林工程系
年份:2018
卷号:31
期号:2
起止页码:19-25
中文期刊名:林业科学研究
外文期刊名:Forest Research
收录:CSTPCD;;Scopus;北大核心:【北大核心2017】;CSCD:【CSCD2017_2018】;
基金:国家林业公益性行业科研专项重大项目(201304102);海外及港澳学者合作研究基金项目(31428002)
语种:中文
中文关键词:杨树;光敏色素相互作用因子;表达分析
外文关键词:Populus ; phytochrome-interacting factor ; expression analysis
分类号:S718.46
摘要:[目的]为探究光敏色素相互作用因子(PIF)基因在杨树生长发育中的功能。[方法]利用生物信息学方法预测了杨树基因组中的PIF基因家族成员并对各成员的基因结构、保守基序进行了系统分析;在此基础上,采用实时荧光定量PCR技术检测了PIF成员在不同组织及低温、干旱和Na Cl胁迫下的表达模式。[结果]表明:杨树基因组中至少含有10个Pt PIF成员,这些成员在进化上相对保守,均具有典型的b HLH结构域。基因表达分析显示:Pt PIF基因在杨树不同组织及不同非生物胁迫条件下存在明显的表达差异。[结论]杨树Pt PIF基因家族包含10个成员参与不同的生物学过程,研究结果将为深入解析杨树Pt PIF基因的功能奠定了基础。
[ Objective ] To study the function of phytochrome interacting factor (PIF) in Populus. [ Method I The molecular characteristics analysis of PIF was conducted, including gene family members, gene structure and con- served motifs. The expression profiles of PIF family members in different tissues were tested under cold, drought and NaCI stresses with real-time quantitative PCR. [ Result ] The results of bioinformatics analysis showed that there were at least ten PtPIF members in Populus and the PtPIF genes were conserved during evolution of species, all of them contained bHLH domain. [ Conclusion ] The result of qRT-PCR revealed that PtPIF has distinct expression pattern across different tissues and under different abiotic stress conditions. Present study provides references for fur- ther decipher the function of PtPIF in Populus.
参考文献:
正在载入数据...