文献类型：专利

中文题名：一种基于线粒体全基因组对延庆腮扁叶蜂系统发育的分析方法

作者：王梅[1] 庄佳亮[1] 王鸿斌[1] 李国宏[1] 刘梦飞[1]

第一作者：王梅

机构：[1]中国林业科学研究院森林生态环境与自然保护研究所(国家林业和草原局世界自然遗产保护研究中心);

专利类型：发明专利

申请号：CN202410594147.1

申请日：20240514

申请人地址：100091 北京市海淀区东小府2号

公开日：20240802

代理人：郑怿

代理机构：北京一枝笔知识产权代理事务所(普通合伙)

语种：中文

中文关键词：系统发育分析;线粒体;线粒体全基因组;组装;比对;高通量测序技术;线粒体基因;基因组DNA;二级结构;近缘物种;叶蜂总科;原始数据;再利用;重排;质量控制;测序;迭代;构建;亚目;分析;筛选;发育;评估;预测;发现;成功

分类号：Q96

年份：2024

摘要：本发明公开了一种基于线粒体全基因组对延庆腮扁叶蜂系统发育的分析方法，涉及延庆腮扁叶蜂系统发育分析技术领域。提取延庆腮扁叶蜂的基因组DNA，使用高通量测序技术测定，将得到的原始数据进行质量控制、分析、评估和组装，将得到的组装后的contig与近缘物种线粒体基因进行比对，筛选得到来自线粒体的contig，再利用MITObim v1.6迭代比对等步骤。本发明通过测序组装等一系列过程得到了延庆腮扁叶蜂的线粒体全基因组，发现了扁叶蜂总科内新的线粒体重排现象，成功预测了tRNA二级结构并且构建了有效的系统发育分析，与前人的工作得到了很好的印证，为广腰亚目线粒体的系统发育分析提供了重要的材料。