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核桃qRT-PCR内参基因的筛选与不定根发生相关基因表达分析    

文献类型:期刊文献

中文题名:核桃qRT-PCR内参基因的筛选与不定根发生相关基因表达分析

作者:宋晓波[] 常英英[] 刘昊[] 徐慧敏[] 裴东[]

第一作者:宋晓波

机构:[1]林木遗传育种国家重点实验室国家林业和草原局中国林业科学研究院林业研究所;[2]天津市林业果树研究所;[3]河南省洛宁县林业局;

年份:2019

中文期刊名:园艺学报

基金:中央级公益性科研院所基本科研业务费专项“核桃提质增效关键技术研究”(CAFYBB2017ZA004-2);国家自然科学基金项目“核桃复幼提高生根能力的多基因作用机制解析”(31672126);

语种:中文

中文关键词:核桃;不定根;内参基因;表达分析;

分类号:S664.1

摘要:确定核桃(Juglans reiga)不定根发生过程中高效、稳定表达的内参基因,研究不定根发生相关基因的表达模式,对于核桃等多年生木本植物的扦插繁殖具有重要意义。本研究通过荧光定量PCR技术和Ge Norm、NormFinder软件对8个候选内参基因(18S、ACT、ACT2、TUB、H2B、UBI、EF2和UBQ)在不定根发生过程中的表达稳定性进行评估。利用筛选出的最佳内参基因进行校正,对12个重要功能基因(YUC4、PIN6、AUX/IAA8、SAUR24、WOX11、WOX5、LBD16、WRKY14、SHR、SCL、CYCA和CYCD)在核桃不定根发生过程中的表达水平进行定量分析。内参基因表达稳定性分析结果显示:ACT2基因可以作为核桃不定根发生过程q RT-PCR研究的最佳内参基因;以ACT2为内参,对不定根发生过程的12个基因的表达水平进行定量分析,结果显示:YUC基因在扦插过程中持续显著下调表达,其余11个基因均在不定根发生的不同时期显著上调表达。由此推测:PIN6等基因介导的生长素极性运输对于不定根发生初期所需的高浓度IAA富集具有重要作用;SHR、WOX11、LBD16、WRKY14和SCL基因主要参与形成层细胞向根原基原始细胞的转化过程,SAUR24、WOX5、CYCA和CYCD基因主要参与根原基原始细胞向根原基细胞转变的调控;同时,细胞周期蛋白相关基因(CYCA、CYCD)可以作为插穗进入根原基原始细胞向根原基细胞转变阶段的标志基因。

参考文献:

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