文献类型：专利

中文题名：二代测序对转基因植物外源基因插入信息的鉴定及应用

作者：唐芳[1] 谢坤[1] 辛槐根[1] 赵树堂[1]

第一作者：唐芳

机构：[1]中国林业科学研究院林业研究所;

专利类型：发明公开

申请号：CN202511144576.X

申请日：20250815

申请人地址：100091 北京市海淀区东小府2号

公开日：20251118

代理人：王颖

代理机构：北京维创华成知识产权代理事务所(普通合伙) 16094

语种：中文

中文关键词：测序;对转;基因植物;外源基因;插入信息;鉴定;转基因植物;插入位点;拷贝数;植物样本;DNA;高通量;novaseq;建库;过滤;原始;测序数据;整合;基因片段;受体基因组;参考基因;测序片段;序列比对;受体染色体;外源目的基因;片段插入;频次;编码基因;植物;转基因技术

年份：2025

摘要：本发明属于植物转基因技术领域，具体为二代测序对转基因植物外源基因插入信息的鉴定及应用。本发明以杨树转基因不同株系的植株为材料，进行二代测序，通过测序reads与外源目的基因片段和受体基因组进行比对，利用比对深度的比较和外源基因比对结果等，以鉴定受体染色体上发生外源目的基因片段插入的频次及外源目的基因片段插入位点，通过perl程序快速查找到插入位点位于受体基因组中编码基因的具体位置。