文献类型：专利

中文题名：一种三代测序对外源基因插入信息的鉴定方法

作者：唐芳[1] 谢坤[1] 辛槐根[1] 赵树堂[1]

第一作者：唐芳

机构：[1]中国林业科学研究院林业研究所;

专利类型：发明公开

申请号：CN202511144574.0

申请日：20250815

申请人地址：100091 北京市海淀区东小府2号

公开日：20251118

代理人：王颖

代理机构：北京维创华成知识产权代理事务所(普通合伙) 16094

语种：中文

中文关键词：测序;对外;源基因;插入信息;鉴定;高通量;对转;基因植物;外源基因片段;插入位点;拷贝数;植物样本;DNA;ONT;建库;整合;受体基因组;参考基因;测序片段;序列比对;频次;外源目的基因;片段插入;编码基因;植物;转基因技术;作物;林木育种;破物;界限

年份：2025

摘要：本发明属于植物转基因技术领域，具体涉及一种三代测序对外源基因插入信息的鉴定方法。本发明以杨树转基因不同株系的植株为材料，进行高通量三代ONT测序，通过与外源目的基因片段和受体银腺杨84K的基因组进行比对，利用比对的测序深度比较和外源基因比对结果获得杨树外源基因插入受体基因组的拷贝数和插入位点，并通过自编的程序快速查找到外源目的基因插入受体基因组中编码基因的精确位置。