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牡丹PsCS基因的克隆及序列分析     被引量:4

Cloning and Sequence Analysis of PsCS Gene in Tree Peony

文献类型:期刊文献

中文题名:牡丹PsCS基因的克隆及序列分析

英文题名:Cloning and Sequence Analysis of PsCS Gene in Tree Peony

作者:任磊[1] 王雁[1] 周琳[1] 彭镇华[1]

第一作者:任磊

机构:[1]中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室

年份:2011

期号:9

起止页码:81-85

中文期刊名:生物技术通报

外文期刊名:Biotechnology Bulletin

收录:CSTPCD;;北大核心:【北大核心2008】;CSCD:【CSCD_E2011_2012】;

基金:国家"863"项目(2006AA100109)

语种:中文

中文关键词:牡丹;柠檬酸合成酶基因克隆;生物信息学分析

外文关键词:Tree peony Cloning of citrate synthase Bioinformatics analysis

分类号:Q78

摘要:以牡丹品种‘赵粉’(Paeonia suffruticosa L.cv.‘Zhao Fen’)为试材,采用RT-PCR和RACE方法从雄蕊中获得了一个牡丹柠檬酸合成酶(citrate synthase,CS)基因cDNA全长,命名为PsCS,GenBank登录号为HQ449568。其cDNA全长1 564 bp,包含75 bp的5'非编码区、73 bp的3'非编码区和一个长度为1 416 bp编码471个氨基酸的开放阅读框。序列比对和系统进化分析表明,PsCS与葡萄的亲缘关系最近,相似性达89.4%以上。
In this work,a full-length cDNA sequence of CS gene was obtained from petals of tree peony(Paeonia suffruticosa L.cv.'Zhao Fen')using RT-PCR and RACE,named PsCS(GenBank accession No.HQ449568).The full length of PsCS cDNA is 1 564 bp,containing a 5′ untranslated region(5′ UTR)of 75 bp,a 3′ UTR of 73 bp,and an opening reading frame(ORF)of 1 416 bp encoding a 471 predicted amino acids.Subsequently,sequence comparison and phylogenetic analysis revealed that PsAP1 shared more than 89.4%homology with Vitis vinefera.

参考文献:

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