文献类型：期刊文献

中文题名：文冠果种子发育基因表达分析内参基因的选择

英文题名：Selection of Reference Genes for Gene Expression Analysis in Seed Development of Xanthoceras sorbifolium Bunge

作者：李麟坤[1] 梁重钧[1] 宁楚龙[2] 张薇[1] 姜国维[2] 张鑫[2] 王利兵[1,2]

第一作者：李麟坤

机构：[1]中国林业科学研究院林业研究所,北京100091;[2]西北农林科技大学林学院,陕西杨凌712199

年份：2024

卷号：37

期号：3

起止页码：79-85

中文期刊名：林业科学研究

外文期刊名：Forest Research

收录：CSTPCD;;Scopus;北大核心:【北大核心2023】；CSCD:【CSCD2023_2024】；

基金：国家自然科学基金(31870594);西北农林科技大学高层次人才科研经费。

语种：中文

中文关键词：文冠果;内参基因;基因表达;种子发育

外文关键词：Xanthoceras sorbifolium;reference gene;gene expression;seed development

分类号：S727.32

摘要：[目的]验证ACT基因是否适用于文冠果种子发育的相关基因表达分析,并筛选出在文冠果基因表达分析中最稳定的内参基因。[方法]本研究采用了4种数学算法(ΔCT、BestKeeper、NormFinder、geNorm)评估12个候选内参基因的表达稳定性,并利用在线工具RefFinder综合评价。[结果]在文冠果不同发育时期种子内参基因综合评分排名为PP2A>Tip41> EF-1α>18r>UCE>β-TUB>UBQ>α-TUB>CYP>SAM>ACT>GADPH;在文冠果不同组织内参基因综合评分排名为PP2A>Tip41>CYP>18r>UBQ>SAM>EF-1α>UCE>GADPH>α-TUB>ACT>β-TUB。[结论] PP2A和Tip41基因是文冠果基因表达分析最稳定的内参基因。
[Objective]:To assess the suitability of the ACT gene for gene expression analysis in seed de-velopment of Xanthoceras sorbifolium,and to identify the most stable reference genes for gene expres-sion analysis in X.sorbifolium.[Method]:In this study,four mathematical algorithms(ΔCT,BestKeeper,NormFinder,geNorm)were carried out for evaluating the expression stability of 12 candidate reference genes based on the web-based tool RefFinder.[Result]:The RefFinder result showed that the gene PP2A performed the best,followed byTip41,EF-1α,18r,UCE,β-TUB,UBQ,α-TUB,CYP,SAM,ACT,and GADPH at the different seed development stages in X.sorbifolium,and the gene also had the highest score,followed by Tip41,CYP,18r,UBQ,SAM,EF-1α,UCE,GADPH,α-TUB,ACT,andβ-TUB at various tissues.[Conclusion]:PP2A and Tip41 are the two most stable reference genes for gene expression ana-lysis in X.sorbifolium.