成果/Result
- DNA Barcode Authentication and Library Development for the Wood of Six Commercial Pterocarpus Species: the Critical Role of Xylarium Specimens被引量：57收藏
- 作者：Jiao, Lichao[1,2] Yu, Min[1,2] Wiedenhoeft, Alex C.[3,4,5,6] He, Tuo[1,2] Li, Jianing[7]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry;USDA Forest Serv;Univ Wisconsin;Purdue Univ
- 来源：SCIENTIFIC REPORTS 2018
- DNA barcoding of vouchered xylarium wood specimens of nine endangered Dalbergia species被引量：48收藏
- 作者：Yu, Min[1,2] Jiao, Lichao[1,2] Guo, Juan[1,2] Wiedenhoeft, Alex C.[3,4,5,6] He, Tuo[1,2]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry;US Forest Serv;Univ Wisconsin;Purdue Univ
- 来源：PLANTA 2017
- 关键词：DNA barcode reference database ITS2 trnH-psbA CITES Forensic wood identification Illegal logging
- A strategy for developing high-resolution DNA barcodes for species discrimination of wood specimens using the complete chloroplast genome of three Pterocarpus species被引量：46收藏
- 作者：Jiao, Lichao[1,2] Lu, Yang[1,2] He, Tuo[1,2] Li, Jianing[3] Yin, Yafang[1,2]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Trop Agr Sci
- 来源：PLANTA 2019
- 关键词：Comparative genomics DNA extraction Specific barcode Timber identification Wood anatomy Ycf1b
- DNA barcoding for wood identification: global review of the last decade and future perspective被引量：28收藏
- 作者：Jiao, Lichao[1,2] Lu, Yang[1,2] He, Tuo[1,2] Guo, Juan[1,2] Yin, Yafang[1,2]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry
- 来源：IAWA JOURNAL 2020
- 关键词：Wood identification wood anatomy wood DNA extraction PCR amplification DNA recovery rate reference database xylarium specimens
- Machine learning approaches outperform distance- and tree-based methods for DNA barcoding of Pterocarpus wood被引量：26收藏
- 作者：He, Tuo[1,2,3,4] Jiao, Lichao[1,2] Wiedenhoeft, Alex C.[3,4,5,6] Yin, Yafang[1,2]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry;US Forest Serv;Univ Wisconsin;Purdue Univ
- 来源：PLANTA 2019
- 关键词：DNA barcoding Forensic wood identification Identification accuracy Machine learning approaches (MLAs) Pterocarpus SMO classifier
- DNA barcoding authentication for the wood of eight endangered Dalbergia timber species using machine learning approaches被引量：25收藏
- 作者：He, Tuo[1,2] Jiao, Lichao[1,2] Yu, Min[1,2] Guo, Juan[1,2] Jiang, Xiaomei[1,2]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry
- 来源：HOLZFORSCHUNG 2019
- 关键词：Dalbergia timber species DNA barcoding illegal logging machine learning approaches (MIAs) reference library SMO classifier wood identification
- Machine Learning Models with Quantitative Wood Anatomy Data Can Discriminate between Swietenia macrophylla and Swietenia mahagoni被引量：25收藏
- 作者：He, Tuo[1,2,3] Marco, Joao[3] Soares, Richard[3,4] Yin, Yafang[1,2] Wiedenhoeft, Alex C.[3,4,5,6]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry;US Forest Serv;Univ Wisconsin;Purdue Univ
- 来源：FORESTS 2020
- 关键词：CITES machine learning quantitative wood anatomy SVM Swietenia
- Developing deep learning models to automate rosewood tree species identification for CITES designation and implementation被引量：23收藏
- 作者：He, Tuo[1,2] Lu, Yang[1,2] Jiao, Lichao[1,2] Zhang, Yonggang[1,2] Jiang, Xiaomei[1,2]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry
- 来源：HOLZFORSCHUNG 2020
- 关键词：CITES Dalbergia deep learning models Pterocarpus rosewood tree species wood identification
- Wood discrimination analyses of Pterocarpus tinctorius and endangered Pterocarpus santalinus using DART-FTICR-MS coupled with multivariate statistics被引量：17收藏
- 作者：Zhang, Maomao[1,2,3] Zhao, Guang Jie[2] Liu, Bo[1,3] He, Tuo[1,3] Gu, Juan[1,3]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Beijing Forestry Univ;Chinese Acad Forestry
- 来源：IAWA JOURNAL 2019
- 关键词：Mass spectrometry wood identification xylarium wood extract OPLS-DA models machine learning methods
- Ancient plastid genomes solve the tree species mystery of the imperial wood "Nanmu" in the Forbidden City, the largest existing wooden palace complex in the world被引量：15收藏
- 作者：Jiao, Lichao[1,2] Lu, Yang[1,2] Zhang, Ming[3] Chen, Yongping[1] Wang, Zhaoshan[4]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Natl Forestry & Grassland Adm;Northwest Univ;Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Sci
- 来源：PLANTS PEOPLE PLANET 2022
- 关键词：ancient DNA archeological wood Forbidden City Phoebe species identification wood anatomy
- 木材树种计算机视觉识别技术发展与应用被引量：12收藏
- 作者：何拓[1] 刘守佳[1] 陆杨[1] 焦立超[1] 殷亚方[1]
- 机构：中国林业科学研究院木材工业研究所
- 来源：《林业工程学报》 2021
- 关键词：计算机视觉识别技术 木材识别 深度学习 构造图像 特征自动化提取
- 摘要：我国是全球林产品生产、贸易和消费第一大国,因此受到国际社会的广泛关注。在木材和木制品贸易流通环节经常出现以假乱真、以次充好的现象,为国际履约执法和林产品产业监管带来严峻挑战。基于木材解剖的传统木材树种识别方法,一般只能识...
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- Applicability of chloroplast DNA barcodes for wood identification between Santalum album and its adulterants被引量：12收藏
- 作者：Jiao, Lichao[1,2] He, Tuo[1,2] Dormontt, Eleanor E.[3] Zhang, Yonggang[1,2] Lowe, Andrew J.[3]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry;Univ Adelaide
- 来源：HOLZFORSCHUNG 2019
- 关键词：barcode combinations psbA-trnH and trnK DNA barcode illegal logging neighbor-joining (NJ) method sandal wood species identification TaxonDNA method
- 木材信息学:发展、应用与展望被引量：9收藏
- 作者：何拓[1,2] 焦立超[1,2] 郭娟[1,2] 殷亚方[1,2]
- 机构：中国林业科学研究院木材工业研究所;中国林业科学研究院木材标本馆
- 来源：《木材科学与技术》 2021
- 关键词：木材信息学 细胞壁 木材性质 科学数据 交叉学科
- 摘要：简要介绍木材科学和信息学发展以及信息学在木材科学领域的应用,在此基础上,首次提出“木材信息学”概念,分别从定义和框架、研究内容和应用等方面对“木材信息学”进行阐述,并展望“木材信息学”的发展。
- 其他来源数据库：万方期刊数据库同方期刊数据库
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- Ray Traits of Juvenile Wood and Mature Wood: Pinus massonia and Cunninghamia lanceolata被引量：8收藏
- 作者：Meng, Qiulu[1,2,3] Fu, Feng[2] Wang, Jie[2,3] He, Tuo[2,3] Jiang, Xiaomei[2,3]
- 机构：Guangxi Univ;Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry
- 来源：FORESTS 2021
- 关键词：conifer wood anatomy juvenile wood mature wood ray
- An optimized DNA extraction protocol for wood DNA barcoding of Pterocarpus erinaceus被引量：8收藏
- 作者：Lu, Yang[1,2] Jiao, Lichao[1,2] He, Tuo[1,2] Zhang, Yonggang[1,2] Jiang, Xiaomei[1,2]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry
- 来源：IAWA JOURNAL 2020
- 关键词：DNA barcode extraction time droplet digital PCR sample amount timber identification wood anatomy
- 第18届CITES缔约方大会木材树种管制变化被引量：7收藏
- 作者：焦立超[1] 何拓[1] 尹江苹[1] 陆杨[1] 袁良琛[2]
- 机构：中国林科院木材工业研究所;中华人民共和国濒危物种进出口管理办公室
- 来源：《木材工业》 2019
- 关键词：CITES 附录修订 濒危木材 国际贸易
- 摘要：2019年8月在瑞士日内瓦召开的濒危野生动植物种国际贸易公约(CITES公约)第18届缔约方大会上,新增附录Ⅱ树种3属共19种,分别为姆兰杰南非柏、染料紫檀和洋椿属所有种(仅限新热带种群);并修订了附录Ⅱ管制的黄檀属、3...
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- Can quantitative wood anatomy data coupled with machine learning analysis discriminate CITES species from their look-alikes?被引量：6收藏
- 作者：Liu, Shoujia[1,2] He, Tuo[1,2] Wang, Jiajun[1] Chen, Jiabao[1,2] Guo, Juan[1,2]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry;USDA;Univ Wisconsin;Purdue Univ
- 来源：WOOD SCIENCE AND TECHNOLOGY 2022
- 关键词：Classifiers - Conservation - Decision trees - Machine learning - Timber
- CITES濒危木材管理政策及我国履约对策研究被引量：5收藏
- 作者：何拓[1,2] 刘守佳[1,2] 尹江苹[1] 焦立超[1,2] 李开凡[3]
- 机构：中国林业科学研究院木材工业研究所;中国林业科学研究院木材标本馆;国家林业和草原局野生动植物保护司(中华人民共和国濒危物种进出口管理办公室)
- 来源：《木材科学与技术》 2022
- 关键词：CITES 濒危木材 管理政策 履约对策
- 摘要：濒危木材国际贸易引发的森林退化,加剧了野生动植物栖息地丧失和生物多样性破坏。《濒危野生动植物种国际贸易公约》(CITES)通过对包括濒危木材物种在内的野生动植物国际贸易进行管制,防止过度利用危及物种的生存。本文介绍CIT...
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- 机器学习方法在木材树种识别领域的应用被引量：4收藏
- 作者：刘守佳[1,2] 汪嘉君[1,2,4] 陆杨[1,2] 郑昌[1,2] 焦立超[1,2]
- 机构：中国林业科学研究院木材工业研究所;国家林业和草原局木材标本资源库;国家林业和草原局野生动物保护监测中心;国家文物局考古研究中心
- 来源：《世界林业研究》 2023
- 关键词：机器学习 木材识别 定量解剖 计算机视觉 化学指纹图谱 DNA条形码
- 摘要：随着全球林产品贸易量的剧增和木材非法贸易活动的加剧,珍稀濒危树种保护成为国际社会关注的焦点。发展科学准确的木材识别方法是保护全球森林资源、促进林产品国际贸易健康发展的重要途径。近年来,随着木材科学领域与计算机技术的不断交...
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- A computer-aided method for identifying the presence of softwood growth ring boundaries被引量：4收藏
- 作者：Lin, Qizhao[1] He, Tuo[2,3] Sun, Yongke[1] He, Xin[1] Qiu, Jian[1]
- 机构：Southwest Forestry Univ;Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry
- 来源：PLOS ONE 2020
- Anatomical adaptions of pits in two types of ray parenchyma cells in Populus tomentosa during the xylem differentiation被引量：4收藏
- 作者：Yin, Lijuan[1,2] Jiang, Xiaomei[2] Ma, Lingyu[2] Liu, Shoujia[2] He, Tuo[2]
- 机构：Inner Mongolia Agr Univ;Chinese Acad Forestry
- 来源：JOURNAL OF PLANT PHYSIOLOGY 2022
- 关键词：Ray parenchyma cell Pit Xylem differentiation Isolation cell Contact cell
- Similarity network fusion for aggregating headspace GC-MS and direct analysis in real time-mass spectrometry data from solid samples to enhance species identification efficiency of high-temperature heated wood被引量：3收藏
- 作者：Zhang, Maomao[1,2,3] Guo, Juan[2,3] Lu, Yang[2,3] Jiao, Lichao[2,3] He, Tuo[2,3]
- 机构：Xian Univ Architecture & Technol;Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry
- 来源：JOURNAL OF WOOD SCIENCE 2022
- 关键词：Wood identification Headspace-gas chromatography-mass spectrometry (HS-GC-MS) Similarity network fusion (SNF) High-temperature heated wood Direct analysis in real time-mass spectrometry (DART-MS)
- Opening the black box: explainable deep-learning classification of wood microscopic image of endangered tree species被引量：2收藏
- 作者：Zheng, Chang[1,2] Liu, Shoujia[1,2] Wang, Jiajun[1,2,4] Lu, Yang[1,2] Ma, Lingyu[1,2]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry;Natl Forestry & Grassland Adm;Natl Ctr Archaeol
- 来源：PLANT METHODS 2024
- 关键词：Computer vision Deep learning Feature visualization Image classification Wood identification
- Organellar microcapture to extract nuclear and plastid DNA from recalcitrant wood specimens and trace evidence被引量：2收藏
- 作者：Costa, Adriana[1,3] Giraldo, Giovanny[2,3] Bishell, Amy[3] He, Tuo[4,5] Kirker, Grant[1,3]
- 机构：Mississippi State Univ;Univ Wisconsin;Forest Prod Lab;Chinese Res Inst Wood Ind;Chinese Acad Forestry
- 来源：PLANT METHODS 2022
- 关键词：Organellar microcapture Nucleus isolation Plastid isolation Single-cell sequencing Wood identification
- How to discriminate wood of CITES-listed tree species from their look-alikes: using an attention mechanism with the ResNet model on an enhanced macroscopic image dataset被引量：1收藏
- 作者：Liu, Shoujia[1,2] Zheng, Chang[1,2] Wang, Jiajun[1,2,3] Lu, Yang[1,2] Yao, Jie[4]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry;Natl Ctr Archaeol;Beijing Informat Sci & Technol Univ;Natl Forestry & Grassland Adm
- 来源：FRONTIERS IN PLANT SCIENCE 2024
- 关键词：wood identification CITES convolutional neural network attention mechanism data enhancement macroscopic images
- 一种DNA条形码及鉴别楠属和润楠属中多种木材的方法被引量：0收藏
- 作者：焦立超[1] 陆杨[1] 殷亚方[1] 郭雨[1] 王杰[1]
- 机构：中国林业科学研究院木材工业研究所
- 来源：《CN114540532A》 2022
- 关键词：质体基因组 扩增产物 条形码 木粉 鉴别 系统发育进化树 木材 条形码序列 准确度 低温环境 方法识别 木材样品 取样量少 物种鉴别 序列信息 研磨 木制品 测序 位点
- 摘要：本发明公开了一种DNA条形码及鉴别楠属和润楠属中多种木材的方法，包括基于质体基因组序列rps16?psbI、psbE?petG、rps8?rpl16、rpl23?ycf2、ndhF?ccsA和ycf1中的任意2种以上或全...
- 一种鉴别9种黄檀属木材的DNA组合条形码及其鉴别方法和应用被引量：0收藏
- 作者：殷亚方[1] 余敏[1] 焦立超[1] 何拓[1] 郭娟[1]
- 机构：中国林业科学研究院木材工业研究所
- 来源：《CN107287300B》 2018
- 关键词：条形码 鉴别 木材 国际贸易公约 条形码序列 野生动植物 传统木材 高效可靠 技术支持 木材经营 执法部门 质量检验 贸易 检疫 海关 应用
- 摘要：本发明公开了一种鉴别9种黄檀属木材的DNA组合条形码，所述DNA组合条形码是条形码序列trnL、trnH?psbA、trnV?trnM或ITS2中的任意2种以上或全部组合形成的DNA组合条形码。本发明还公开了一种鉴别9种...
- 一种木材靶向细胞DNA提取方法被引量：0收藏
- 作者：焦立超[1] 陆杨[1] 殷亚方[1] 何拓[1] 李姗[1]
- 机构：中国林业科学研究院木材工业研究所
- 来源：《CN110408613B》 2020
- 关键词：木材 靶向细胞 木材组织 提取DNA 去除 分子生物学研究 倒置显微镜 木材抽提物 木材细胞壁 分离富集 技术支持 木材表面 木材物种 外源污染 原位检测 裂解 切片 吸附 溶解 瞄准 细胞 应用
- 摘要：本发明公开了一种木材靶向细胞DNA精准提取方法，通过木材表面外源污染去除、木材DNA原位检测、木材组织径向切片、倒置显微镜下精准分离富集DNA的木材靶向细胞、木材细胞壁裂解、木材抽提物去除、DNA沉淀吸附、溶解、纯化及P...
- 木质复合材料高尺寸稳定性能预测方法和装置被引量：0收藏
- 作者：郭娟[1] 郑昌[1] 何拓[1] 殷亚方[1] 焦立超[1]
- 机构：中国林业科学研究院木材工业研究所
- 来源：《CN116187737A》 2023
- 关键词：尺寸稳定 木质复合材料 机器学习模型 关键特征 预测 生产工艺数据 生产工艺优化 方法和装置 结构数据 快速预测 林业工程 木材单板 生产实践 性能预测 产能 加工 应用
- 摘要：本发明公开了一种木质复合材料高尺寸稳定性能预测方法和装置，属于林业工程领域。本发明训练得到了能够预测出木质复合材料高尺寸稳定性能的机器学习模型，并找出了影响木质复合材料的高尺寸稳定性能的关键特征。本发明可以应用于高尺寸稳...
- 一种木质文物的古DNA捕获方法被引量：0收藏
- 作者：焦立超[1] 殷亚方[1] 陆杨[1] 郭雨[1] 郭娟[1]
- 机构：中国林业科学研究院木材工业研究所
- 来源：《CN114395554B》 2023
- 关键词：木质文物 有效获取 样本 饱水木质文物 真空冷冻干燥 常规木材 典型特征 木材细胞 外源污染 细胞裂解 杂交捕获 研磨 外源DNA 漂洗 富集 干态 降解 可用 取样 去除 脱水 捕获 损伤 聚焦 树种 修复 污染
- 摘要：本发明公开了一种木质文物的古DNA捕获方法，依次包括：取样，去除样本内部及外表面存在的外源DNA污染，通过真空冷冻干燥脱水、样本研磨、漂洗、细胞裂解、DNA基因组富集、杂交捕获来有效获取木质文物古DNA。本发明聚焦木质文...
