成果/Result
- 银杏细胞转录组高通量测序及分析被引量：15收藏
- 作者：张楠[1] 孙桂玲[2] 戴均贵[3] 杨艳芳[1] 刘洪伟[1]
- 机构：中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室;中国科学院昆明植物研究所资源植物与生物技术重点实验室;中国医学科学院/北京协和医学院药物研究所天然药物活性物质与功能国家重点实验室
- 来源：《中国生物工程杂志》 2013
- 关键词：银杏细胞 Genome Analyzer IIx 转录组
- 摘要：利用Illumina的Genome Analyzer IIx对银杏(Ginkgo Biloba)细胞转录组进行高通量测序,挖掘银杏内酯和紫杉醇生物合成基因,特别是新的羟基化酶基因,为今后最终完善红豆杉细胞紫杉醇生物合成途...
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- 红豆杉属植物中紫杉烷化合物含量比较与分析被引量：15收藏
- 作者：吴长桥[1,2] 蒋路园[1,3] 杨艳芳[1] 陆英[2] 唐其[2]
- 机构：中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室;湖南农业大学园艺学院;河北农业大学园艺学院
- 来源：《中草药》 2021
- 关键词：紫杉醇 巴卡亭Ⅲ 10-去乙酰基巴卡亭Ⅲ 10-去乙酰基紫杉醇 三尖杉宁碱 10-去乙酰基-7-木糖基紫杉醇 中国红豆杉 东北红豆杉 云南红豆杉 西藏红豆杉 南方红豆杉 曼地亚红豆杉
- 摘要：目的分析和比较5种红豆杉中6种紫杉烷类化合物含量的差异。方法利用乙醇超声浸提后得到样品溶液;通过高效液相色谱法测定和相关性分析、回归分析和聚类分析比较紫杉醇、巴卡亭Ⅲ、10-去乙酰基巴卡亭Ⅲ(10-deacetylbac...
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- 红豆杉分子生物学研究进展被引量：10收藏
- 作者：周华[1] 朱祺[1] 杨艳芳[2] 余发新[1] 邱德有[2]
- 机构：江西省科学院生物资源研究所、江西省观赏植物遗传改良重点实验室;中国林业科学研究院林业研究所、林木遗传育种国家重点实验室
- 来源：《植物生理学报》 2014
- 关键词：红豆杉 基因克隆 转录因子 分子标记 转录组测序
- 摘要：红豆杉作为抗癌药物紫杉醇的药源植物得到了国际上的广泛关注。本文综述了近年来国内外关于红豆杉分子生物学方面的研究进展,主要包括编码紫杉醇生物合成的紫杉二烯合成酶、羟基化酶、酰基转移酶等功能基因以及相关转录因子编码基因的分离...
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- 南方红豆杉bHLH基因克隆与序列分析被引量：10收藏
- 作者：周华[1] 朱祺[1] 杨艳芳[2] 刘洪伟[2] 余发新[1]
- 机构：江西省观赏植物遗传改良重点实验室、江西省科学院生物资源研究所;林木遗传育种国家重点实验室、中国林业科学研究院林业研究所、林木遗传育种国家重点实验室
- 来源：《植物研究》 2015
- 关键词：红豆杉属 bHLH 基因克隆 序列分析 紫杉醇
- 摘要：以南方红豆杉为试材,利用RT-PCR方法从南方红豆杉c DNA中克隆了一个b HLH转录因子——Tc MYC,Gen Bank注册号为KC878013。通过生物信息学分析,发现该基因全长1 959 bp,编码一个650个...
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- 紫杉醇生物合成研究历史、现状及展望被引量：9收藏
- 作者：邱德有[1] 张彬[2] 杨艳芳[1] 邵芬娟[1] 滕文静[2]
- 机构：中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室;国家知识产权局专利局专利审查协作北京中心
- 来源：《生物技术通报》 2015
- 关键词：紫杉醇 生物合成 现状 前景
- 摘要：紫杉醇是从红豆杉中分离出来的一种二萜类化合物,是目前临床上使用最广泛的抗癌药物之一。回顾了紫杉醇生物合成的研究历史,主要包括参与红豆杉紫杉醇生物合成的结构基因、调控基因、红豆杉代谢组、内生真菌紫杉醇生物合成研究历史以及国...
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- 菊花DmDREBa/b基因提高转基因烟草耐逆性研究被引量：7收藏
- 作者：武剑[1] 杨艳芳[2] 王慧[1] 朱凯[1] 刘黎卿[3]
- 机构：南京农业大学大豆研究所国家大豆改良中心作物遗传与种质创新国家重点实验室;中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室国家林业局林木培育重点实验室;福建省植物生理生化重点公共实验室福建省亚热带植物研究所;南京农业大学园艺学院观赏园艺系
- 来源：《分子植物育种》 2016
- 关键词：菊花 DREB 耐逆性 烟草转化
- 摘要：本研究组前期从菊花(Dendranthema morifolium)中克隆得到两个DREB同源基因-Dm DREBa/b,发现两者都受到低温诱导。为了进一步探究该基因的功能,本研究通过农杆菌介导的叶盘转化法将Dm DRE...
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- 过量表达菊花DmDREBa基因提高转化烟草耐低温能力被引量：6收藏
- 作者：杨艳芳[1] 武剑[2] 朱凯[2] 刘黎卿[3] 陈发棣[4]
- 机构：中国林业科学研究院林业研究所;南京农业大学大豆研究所;福建省植物生理生化重点公共实验室;南京农业大学园艺学院观赏园艺系
- 来源：《植物研究》 2016
- 关键词：菊花 DREB 农杆菌转化 转基因烟草 耐逆性
- 摘要：各种环境因素,如干旱、高盐、激素和低/高温等非生物胁迫对植物的生长发育造成很大影响。DREB转录因子在植物抵抗非生物胁迫中起到关键作用。本研究通过根癌农杆菌介导的叶盘转化法将菊花DmD REBa基因导入烟草中并进行了耐低...
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- 红豆杉总RNA提取方法的比较被引量：6收藏
- 作者：张恺恺[1,2] 李清[2] 惠楠[2] 陈段芬[1] 邱德有[2]
- 机构：河北农业大学园艺学院;中国林业科学研究院林业研究所
- 来源：《分子植物育种》 2019
- 关键词：红豆杉(Taxus chinensis) 总RNA 提取方法
- 摘要：为了确立红豆杉总RNA的最适提取方法,本研究以南方红豆杉嫩叶和曼地亚红豆杉愈伤组织为材料,比较了改良十六烷基三甲基溴化铵(Hexadecyl trimethyl ammonium bromide,CTAB)法、试剂盒法和...
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- 甘菊DINAC1转录因子基因提高烟草耐高温能力被引量：2收藏
- 作者：朱凯[1] 武剑[1] 杨艳芳[2] 陈发棣[3] 喻德跃[1]
- 机构：南京农业大学大豆研究所;中国林业科学研究院林业研究所;南京农业大学园艺学院观赏园艺系
- 来源：《植物研究》 2017
- 关键词：菊花 NAC转录因子 生物信息学 高温胁迫 转基因烟草
- 摘要：研究针对从甘菊中克隆获得的DINAC1基因（GenBank登录号为EF602305）进行生物信息学分析，并利用根癌农杆菌介导的叶盘转化法将该基因在烟草中进行过表达研究。结果发现DINAC1蛋白具有较高亲水性，二级结构中占...
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- 甜菜树贝壳杉烯合酶基因的克隆与原核表达被引量：2收藏
- 作者：刘洪伟[1] 王帅[1] 王强[2] 王伟[3] 杨艳芳[1]
- 机构：林木遗传育种国家重点实验室中国林业科学研究院林业研究所;四川农业大学农学院;中国医学科学院/中国协和医科大学药物研究所;中国科学院昆明植物研究所植物化学与西部植物资源持续利用国家重点实验室
- 来源：《食品与生物技术学报》 2017
- 关键词：甜菜树 贝壳杉烯合酶 原核表达 气质联用
- 摘要：本文作者研究了赤霉素合成途径中的关键酶-贝壳杉烯合酶,对其功能的研究可以为以后优化品种提供基因层面的基础。首先通过RACE-PCR技术,从甜菜树叶片中克隆得到贝壳杉烯合酶基因(Ent-kaurene synthase g...
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- 曼地亚红豆杉NAC基因家族鉴定及表达分析被引量：2收藏
- 作者：张恺恺[1] 杨立莹[3] 丰美静[1,2] 张林凤[1] 陈段芬[2]
- 机构：中国林业科学研究院林业研究所;河北农业大学园艺学院;中国花卉协会
- 来源：《林业科学研究》 2022
- 关键词：红豆杉 NAC基因 基因鉴定 表达分析
- 摘要：[目的]筛选红豆杉NAC转录因子家族中影响根系形成的关键基因,探索红豆杉根系生长发育分子机理。[方法]利用曼地亚红豆杉全长转录组数据,通过生物信息学方法鉴定NAC转录因子,并对筛选出的NAC转录因子进行蛋白结构及基因组织...
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- 中国红豆杉TcAPLs基因的克隆及表达分析被引量：2收藏
- 作者：李艳艳[1] 杨艳芳[1] 刘洪伟[1] 王帅[1] 邱德有[1]
- 机构：中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室
- 来源：《中草药》 2015
- 关键词：中国红豆杉 APL基因 基因克隆 生物信息学分析 表达
- 摘要：目的克隆中国红豆杉altered phloem development(APL)基因,研究APL在中国红豆杉剥皮后树皮再生过程中的表达状况,以揭示其可能的调控作用机制。方法利用反转录PCR(RT-PCR)方法克隆得到3个...
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- 红豆杉TbAP2基因荧光定量PCR体系的建立及优化被引量：2收藏
- 作者：张恺恺[1,2] 吕星[2] 杨立莹[2] 陈段芬[2] 邱德有[1]
- 机构：中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室国家林业和草原局林木培育重点实验室;河北农业大学园艺学院
- 来源：《林业科学研究》 2019
- 关键词：红豆杉 AP2 正交试验 实时荧光定量PCR
- 摘要：[目的]建立稳定可靠的、适合检测红豆杉(Taxus L.)TbAP2基因表达量的荧光定量PCR实验体系。对于检测该物种中基因的组织特异性表达具有重要意义。[方法]以曼地亚红豆杉细胞为试材,提取总RNA并反转录为cDNA,...
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- 基于高通量测序的瑞香狼毒转录组数据分析被引量：2收藏
- 作者：杨艳芳[1] 刘洪伟[2] 邱德有[1]
- 机构：中国林业科学研究院林业研究所;河北省科学院生物研究所
- 来源：《中草药》 2017
- 关键词：瑞香狼毒 转录组 萜类 佛波酯 代谢通路
- 摘要：目的获得瑞香狼毒Stellera chamaejasme转录组数据库代谢途径基因序列、SSR以及转座子等信息。方法以瑞香狼毒根作为受试材料,采用二代测序方法中的Illumina Hi Seq 2000进行转录组测序,并进...
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- 榛子产紫杉醇内生真菌Penicillium aurantiogriseum中GGPP合酶基因的克隆与表达被引量：1收藏
- 作者：刘洪伟[1] 杨艳芳[1] 李艳艳[1] 王帅[1] 邱德有[1]
- 机构：林木遗传育种国家重点实验室
- 来源：《广西植物》 2016
- 关键词：内生真菌 GGPP合酶 原核表达 基因克隆 紫杉醇
- 摘要：牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合酶是产紫杉醇内生真菌紫杉醇合成下游途径中的关键步骤之一,在榛子产紫杉醇内生真菌中进行紫杉醇生物合成研究时首先要确认GGPP合酶的存在。该研究通过RT-PCR方法克隆得到了榛子产紫杉醇内生真菌Pen...
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- 红豆杉TcLBDs基因的克隆与表达分析被引量：1收藏
- 作者：李艳艳[1] 杨艳芳[1] 王俊青[2] 王帅[1] 刘洪伟[1]
- 机构：中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室;湖北襄阳市林业科学研究所
- 来源：《林业科学》 2015
- 关键词：红豆杉 LBD 转录因子 生物信息学分析 基因表达
- 摘要：【目的】LBD(LATERAL ORGAN BOUNDARIES DOMAIN)转录因子在植物次生生长中具有潜在的作用。克隆红豆杉LBD基因,研究LBD在红豆杉剥皮后树皮再生过程中的表达状况,以揭示其调控作用。【方法】在...
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- Characterization and expression analysis of genes encoding Taxol biosynthetic enzymes in Taxus spp.被引量：1收藏
- 作者：Luyuan Jiang[1,2] Kaikai Zhang[1] Xing Lv[3] Liying Yang[2] Shuai Wang[4]
- 机构：State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding;College of Horticulture;College of Agronomy;School of Pharmacy
- 来源：Journal of Forestry Research 2021
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- 不同植物中推定蓖麻烯合酶基因的生物信息学分析被引量：0收藏
- 作者：刘洪伟[1] 杨艳芳[1] 熊王丹[2] 吴平治[2] 吴国江[2]
- 机构：林木遗传育种国家重点实验室;中国科学院华南植物园植物资源保护与可持续利用重点实验室
- 来源：《植物研究》 2016
- 关键词：巴豆烷 蓖麻烯合酶 生物信息学
- 摘要：利用GenBank中已登录的完整的麻风树、乳浆大戟、蓖麻和乌桕中的13个蓖麻烯合酶（Casbenesyn．thase，CS；EC4．6．1．7）基因序列，通过生物信息学方法对其核酸及氨基酸序列、组成成分、导肽、信号肽、跨...
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- 南方红豆杉转录组SSR位点分析及其分子标记开发被引量：0收藏
- 作者：蒋路园[1,2] 吴文丽[1] 张恺恺[1] 张林凤[1] 邵芬娟[1]
- 机构：中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种全国重点实验室;河北农业大学园艺学院
- 来源：《中草药》 2024
- 关键词：南方红豆杉 转录组 SSR 东北红豆杉 曼地亚红豆杉
- 摘要：目的基于赤霉素(gibberellin A3,GA3)处理下的南方红豆杉Taxus chinensis var.mairei转录组数据鉴定和分析SSR位点,开发可用于南方红豆杉种质资源鉴定和遗传多样性分析的SSR标记。方...
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- 甘菊DlNAC1转录因子基因提高烟草耐高温能力被引量：0收藏
- 作者：朱凯[1] 武剑[1] 杨艳芳[2] 陈发棣[3] 喻德跃[1]
- 机构：南京农业大学大豆研究所;中国林业科学研究院林业研究所;南京农业大学园艺学院观赏园艺系
- 来源：《植物研究》 2017
- 关键词：菊花 NAC转录因子 生物信息学 高温胁迫 转基因烟草
- 摘要：研究针对从甘菊中克隆获得的DlNAC1基因(Gen Bank登录号为EF602305)进行生物信息学分析,并利用根癌农杆菌介导的叶盘转化法将该基因在烟草中进行过表达研究。结果发现DlAC1蛋白具有较高亲水性,二级结构中占...
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- 红豆杉TcERF基因qRT-PCR体系构建与优化被引量：0收藏
- 作者：蒋路园[1,2] 王旭[3] 张恺恺[1,2] 陈段芬[1] 邱德有[2]
- 机构：河北农业大学园艺学院;中国林业科学研究院林业研究所;河北科技师范学院园艺科技学院
- 来源：《农业生物技术学报》 2020
- 关键词：红豆杉 乙烯响应因子(ERF) 正交试验 qRT-PCR
- 摘要：红豆杉(Taxus sp.)能够产生天然抗癌药物紫杉醇(taxol),但含量极低,开发与利用之间存在严重矛盾。乙烯响应因子(APETALA2/ethylene-responsive factor,AP2/ERF)对红豆杉...
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- 从狼毒大戟中克隆蓖麻烯合成酶基因被引量：0收藏
- 作者：刘洪伟[1,2] 唐其[2,3] 杨艳芳[1,2] 张楠[1,2] 邱德有[1,2]
- 机构：中国林业科学研究院林业研究所;林木遗传育种国家重点实验室;中国医学科学院药用植物研究所广西分所
- 来源：《分子植物育种》 2012
- 关键词：狼毒大戟(Euphorbia fischeriana Steud.) 蓖麻烯合成酶
- 摘要：本研究采用RACE-PCR技术从狼毒大戟(Euphorbia fischeriana Steud.)根中克隆到一个蓖麻烯合成酶(casbene synthase)基因,命名为EfCS(GenBank登录号为:JN8628...
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- 曼地亚红豆杉NPR1基因家族鉴定及表达模式分析被引量：0收藏
- 作者：杜雨晴[1] 袁菊红[2] 王旭[3] 张恺恺[1] 陈段芬[3]
- 机构：中国林业科学研究院林业研究所;江西财经大学艺术学院风景园林与植物资源研究所;河北农业大学园艺学院
- 来源：《中草药》 2024
- 关键词：红豆杉 曼地亚红豆杉 NPR1家族 生物信息学 紫杉醇 表达分析
- 摘要：目的通过鉴定曼地亚红豆杉Taxus×media中病程相关基因非表达子1(non-expressor of pathogenesis-related genes1,NPR1)家族基因,分析并比较其蛋白结构以及基因表达等差异...
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- 红豆杉低温半致死温度和低温胁迫下紫杉烷含量被引量：0收藏
- 作者：蒋路园[1,2] 丰美静[2] 杜雨晴[2] 邸葆[2] 陈段芬[2]
- 机构：中国林业科学研究院林业研究所;河北农业大学园艺学院
- 来源：《生物技术通报》 2023
- 关键词：红豆杉 低温胁迫 电阻抗 低温半致死温度 紫杉烷
- 摘要：通过测定低温胁迫下红豆杉电阻抗参数和紫杉烷含量变化,确定适合红豆杉低温半致死温度测定的电阻抗参数,探讨低温对红豆杉紫杉烷生物合成的影响,为扩大红豆杉引种范围及利用低温条件提高红豆杉中紫杉醇含量奠定了理论基础。以云南红豆杉...
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- 西伯利亚白刺L-半乳糖-1-磷酸磷酸酶基因克隆与序列分析被引量：0收藏
- 作者：高卫东[1,3] 杜雨晴[1] 张林凤[1] 蒋路园[1] 刘园[4]
- 机构：中国林业科学研究院林业研究所;内蒙古大学牧草与特色作物生物学教育部重点实验室;国家林业和草原局国家公园(自然保护地)发展中心;北京市海淀区圆明园管理处
- 来源：《中草药》 2024
- 关键词：西伯利亚白刺 L-半乳糖-1-磷酸磷酸酶基因 基因鉴定 生信分析 基因表达
- 摘要：目的克隆西伯利亚白刺Nitraria sibirica维生素C合成过程中L-半乳糖-1-磷酸磷酸酶(L-galactose-1-phosphate phosphatase,GPP)编码基因。方法利用生物信息学方法对西伯利...
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