- An efficient approach to finding Siraitia grosvenorii triterpene biosynthetic genes by RNA-seq and digital gene expression analysis被引量：136收藏
- 作者：Tang, Qi[1,3] Ma, Xiaojun[1,3] Mo, Changming[3] Wilson, Iain W.[4] Song, Cai[3]
- 机构：Chinese Acad Med Sci;Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Med Sci;CSIRO Plant Ind
- 来源：BMC GENOMICS 2011
- De novo sequencing and a comprehensive analysis of purple sweet potato (Impomoea batatas L.) transcriptome被引量：99收藏
- 作者：Xie, Fuliang[1] Burklew, Caitlin E.[1] Yang, Yanfang[2,3] Liu, Min[4] Xiao, Peng[5]
- 机构：E Carolina Univ;Chinese Acad Forestry;State Key Lab Tree Genet & Breeding;China Agr Univ;E Carolina Univ
- 来源：PLANTA 2012
- 关键词：Anthocyanin Gene expression Microsatellite markers RNA-sequencing Simple sequence repeat (SSR) Sweet potato Transcriptome
- Genome sequencing and analysis of the paclitaxel-producing endophytic fungus Penicillium aurantiogriseum NRRL 62431被引量：96收藏
- 作者：Yang, Yanfang[1] Zhao, Hainan[2] Barrero, Roberto A.[3] Zhang, Baohong[4] Sun, Guiling[5,6]
- 机构：Chinese Acad Forestry;China Agr Univ;Murdoch Univ;E Carolina Univ;Southwest Forestry Univ
- 来源：BMC GENOMICS 2014
- 关键词：Penicillium aurantiogriseum NRRL 62431 Paclitaxel Taxol (TM) Endophytic fungi Genome sequence Horizontal gene transfer
- De novo assembly of Euphorbia fischeriana root transcriptome identifies prostratin pathway related genes被引量：60收藏
- 作者：Barrero, Roberto A.[1] Chapman, Brett[1] Yang, Yanfang[2] Moolhuijzen, Paula[1] Keeble-Gagnere, Gabriel[1]
- 机构：Murdoch Univ;Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Med Sci
- 来源：BMC GENOMICS 2011
- The genome of Populus alba x Populus tremula var. glandulosa clone 84K被引量：51收藏
- 作者：Qiu, Deyou[1] Bai, Shenglong[2] Ma, Jianchao[2] Zhang, Lisha[1] Shao, Fenjuan[1]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Henan Univ;Agr Univ Hebei;Univ Arizona;Univ Arizona
- 来源：DNA RESEARCH 2019
- 关键词：poplar 84K genome sequencing subgenome assignment P. alba P. tremula
- Identification and characterization of MYC transcription factors in Taxus sp.被引量：33收藏
- 作者：Yang Yanfang[1] Zhang Kaikai[1,2] Yang Liying[2] Lv Xing[2] Wu Ying[2]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Agr Univ Hebei;Hebei Acad Sci;Peking Univ
- 来源：GENE 2018
- 关键词：Transcription factor MYC G-box bHLH Taxol Taxus sp.
- Deep Sequencing Reveals Transcriptome Re-Programming of Taxus x media Cells to the Elicitation with Methyl Jasmonate被引量：28收藏
- 作者：Sun, Guiling[1] Yang, Yanfang[2] Xie, Fuliang[3] Wen, Jian-Fan[4] Wu, Jianqiang[1]
- 机构：Chinese Acad Sci;Chinese Acad Forestry;E Carolina Univ;Chinese Acad Sci;CSIRO Plant Ind
- 来源：PLOS ONE 2013
- Transcriptome-wide analysis of AP2/ERF transcription factors involved in regulating Taxol biosynthesis in Taxus x media被引量：17收藏
- 作者：Zhang, Kaikai[1,2] Jiang, Luyuan[1,2] Wang, Xu[3] Han, Hua[4] Chen, Duanfen[2]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Hebei Agr Univ;Hebei Normal Univ Sci & Technol;Chinese Acad Forestry
- 来源：INDUSTRIAL CROPS AND PRODUCTS 2021
- 关键词：Taxus B5 subgroup Gene expression Bioinformatic analysis Taxol
- Molecular cloning and characterization of a cytochrome P450 taxoid 9a-hydroxylase in Ginkgo biloba cells被引量：17收藏
- 作者：Zhang, Nan[1] Han, Zhentai[2] Sun, Guiling[3] Hoffman, Angela[4] Wilson, Iain W.[5]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Sci;Univ Portland;CSIRO Plant Ind
- 来源：BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 2014
- 关键词：Taxol Taxoid 9 alpha-hydroxylase Ginkgo biloba CYP450 Cell-free protein synthesis system LC-MS
- 银杏细胞转录组高通量测序及分析被引量：15收藏
- 作者：张楠[1] 孙桂玲[2] 戴均贵[3] 杨艳芳[1] 刘洪伟[1]
- 机构：中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室;中国科学院昆明植物研究所资源植物与生物技术重点实验室;中国医学科学院/北京协和医学院药物研究所天然药物活性物质与功能国家重点实验室
- 来源：《中国生物工程杂志》 2013
- 关键词：银杏细胞 Genome Analyzer IIx 转录组
- 摘要：利用Illumina的Genome Analyzer IIx对银杏(Ginkgo Biloba)细胞转录组进行高通量测序,挖掘银杏内酯和紫杉醇生物合成基因,特别是新的羟基化酶基因,为今后最终完善红豆杉细胞紫杉醇生物合成途...
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万方期刊数据库
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- 红豆杉属植物中紫杉烷化合物含量比较与分析被引量：15收藏
- 作者：吴长桥[1,2] 蒋路园[1,3] 杨艳芳[1] 陆英[2] 唐其[2]
- 机构：中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室;湖南农业大学园艺学院;河北农业大学园艺学院
- 来源：《中草药》 2021
- 关键词：紫杉醇 巴卡亭Ⅲ 10-去乙酰基巴卡亭Ⅲ 10-去乙酰基紫杉醇 三尖杉宁碱 10-去乙酰基-7-木糖基紫杉醇 中国红豆杉 东北红豆杉 云南红豆杉 西藏红豆杉 南方红豆杉 曼地亚红豆杉
- 摘要：目的分析和比较5种红豆杉中6种紫杉烷类化合物含量的差异。方法利用乙醇超声浸提后得到样品溶液;通过高效液相色谱法测定和相关性分析、回归分析和聚类分析比较紫杉醇、巴卡亭Ⅲ、10-去乙酰基巴卡亭Ⅲ(10-deacetylbac...
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- Whole transcriptome analysis of three leaf stages in two cultivars and one of their F-1 hybrid of Camellia sinensis L. with differing EGCG content被引量：12收藏
- 作者：Lin, Jinke[1] Wilson, Iain W.[2] Ge, Guoping[1,3] Sun, Guiling[4] Xie, Fuliang[5]
- 机构：Fujian Agr & Forestry Univ;CSIRO Agr & Food;Agr Extens Serv Ctr;Chinese Acad Sci;East Carolina Univ
- 来源：TREE GENETICS & GENOMES 2017
- 关键词：Camellia sinensis Tea plant Transcriptome Leaf Epigallocatechin-3-gallate Gene Expression regulation
- 南方红豆杉bHLH基因克隆与序列分析被引量：10收藏
- 作者：周华[1] 朱祺[1] 杨艳芳[2] 刘洪伟[2] 余发新[1]
- 机构：江西省观赏植物遗传改良重点实验室、江西省科学院生物资源研究所;林木遗传育种国家重点实验室、中国林业科学研究院林业研究所、林木遗传育种国家重点实验室
- 来源：《植物研究》 2015
- 关键词：红豆杉属 bHLH 基因克隆 序列分析 紫杉醇
- 摘要：以南方红豆杉为试材,利用RT-PCR方法从南方红豆杉c DNA中克隆了一个b HLH转录因子——Tc MYC,Gen Bank注册号为KC878013。通过生物信息学分析,发现该基因全长1 959 bp,编码一个650个...
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- 东北红豆杉温室扦插繁殖试验被引量：10收藏
- 作者：丰美静[1,2] 张恺恺[1] 黄中文[3] 邱德有[2] 陈段芬[1]
- 机构：河北农业大学园艺学院;中国林业科学研究院林业研究所;河南科技学院生命科技学院
- 来源：《北方园艺》 2020
- 关键词：红豆杉 ABT1 扦插 生根率 温室
- 摘要：以不同品种的红豆杉枝条为试材,利用L9(34)正交实验方法,探讨了在温室环境条件下,东北红豆杉不同插穗年龄、不同浓度ABT1以及不同浸泡时间对扦插繁殖生根率的影响,并确定了通用于其它种红豆杉扦插繁殖的最佳试验方案。结果表...
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- Expression patterns of some genes involved in tanshinone biosynthesis in Salvia miltiorrhiza roots被引量：10收藏
- 作者：Yang, Yanfang[1,2,3] Hou, Shuang[1,2] Fan, Wei[4] Lu, Lilan[5,6] Hui, Nan[3]
- 机构：Chinese Acad Med Sci;Peking Union Med Coll;Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Med Sci
- 来源：INDUSTRIAL CROPS AND PRODUCTS 2019
- 关键词：Salvia miltiorrhiza Tanshinone MEP pathway MVA pathway Gene expression
- 红豆杉分子生物学研究进展被引量：10收藏
- 作者：周华[1] 朱祺[1] 杨艳芳[2] 余发新[1] 邱德有[2]
- 机构：江西省科学院生物资源研究所、江西省观赏植物遗传改良重点实验室;中国林业科学研究院林业研究所、林木遗传育种国家重点实验室
- 来源：《植物生理学报》 2014
- 关键词：红豆杉 基因克隆 转录因子 分子标记 转录组测序
- 摘要：红豆杉作为抗癌药物紫杉醇的药源植物得到了国际上的广泛关注。本文综述了近年来国内外关于红豆杉分子生物学方面的研究进展,主要包括编码紫杉醇生物合成的紫杉二烯合成酶、羟基化酶、酰基转移酶等功能基因以及相关转录因子编码基因的分离...
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- Selection and validation of reference genes for quantitative gene expression normalization in Taxus spp.被引量：9收藏
- 作者：Zhang, Kaikai[1,2] Fan, Wei[3] Chen, Duanfen[2] Jiang, Luyuan[1,2] Li, Yunfeng[4]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Agr Univ Hebei;Chinese Acad Forestry;South China Agr Univ
- 来源：SCIENTIFIC REPORTS 2020
- 紫杉醇生物合成研究历史、现状及展望被引量：9收藏
- 作者：邱德有[1] 张彬[2] 杨艳芳[1] 邵芬娟[1] 滕文静[2]
- 机构：中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室;国家知识产权局专利局专利审查协作北京中心
- 来源：《生物技术通报》 2015
- 关键词：紫杉醇 生物合成 现状 前景
- 摘要：紫杉醇是从红豆杉中分离出来的一种二萜类化合物,是目前临床上使用最广泛的抗癌药物之一。回顾了紫杉醇生物合成的研究历史,主要包括参与红豆杉紫杉醇生物合成的结构基因、调控基因、红豆杉代谢组、内生真菌紫杉醇生物合成研究历史以及国...
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- Identification and characterization of a novel NAC-like gene in chrysanthemum (Dendranthema lavandulifolium)被引量：8收藏
- 作者：Yang, Yanfang[1,2] Zhu, Kai[2] Wu, Jian[2] Liu, Liqing[4] Sun, Guiling[5]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Nanjing Agr Univ;Nanjing Agr Univ;Fujian Inst Subtrop Bot;Chinese Acad Sci
- 来源：PLANT CELL REPORTS 2016
- 关键词：Transcription factor NAC Abiotic stress Chrysanthemum
- Characterization and expression analysis of genes encoding Taxol biosynthetic enzymes in Taxus spp.被引量：7收藏
- 作者：Jiang, Luyuan[1,2] Zhang, Kaikai[1] Lu, Xing[3] Yang, Liying[2] Wang, Shuai[4]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Hebei Agr Univ;Hebei Agr Univ;Liaocheng Univ
- 来源：JOURNAL OF FORESTRY RESEARCH 2021
- 关键词：Gene expression Bioinformatics analysis Acyltransferase Cytochrome P450 Abiotic stress Hormone
- 菊花DmDREBa/b基因提高转基因烟草耐逆性研究被引量：7收藏
- 作者：武剑[1] 杨艳芳[2] 王慧[1] 朱凯[1] 刘黎卿[3]
- 机构：南京农业大学大豆研究所国家大豆改良中心作物遗传与种质创新国家重点实验室;中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室国家林业局林木培育重点实验室;福建省植物生理生化重点公共实验室福建省亚热带植物研究所;南京农业大学园艺学院观赏园艺系
- 来源：《分子植物育种》 2016
- 关键词：菊花 DREB 耐逆性 烟草转化
- 摘要：本研究组前期从菊花(Dendranthema morifolium)中克隆得到两个DREB同源基因-Dm DREBa/b,发现两者都受到低温诱导。为了进一步探究该基因的功能,本研究通过农杆菌介导的叶盘转化法将Dm DRE...
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- Transcriptome analysis of Curcuma wenyujin from Haikou and Wenzhou, and a comparison of the main constituents and related genes of Rhizoma Curcumae被引量：6收藏
- 作者：Lu, Lilan[1,2] Liu, Peiwei[1] Yang, Yanfang[3] Zhang, Yuxiu[1] Wang, Caixia[4]
- 机构：Chinese Acad Med Sci & Peking Union Med Coll;Chinese Acad Trop Agr Sci;Chinese Acad Forestry;Hainan Acad Agr Sci
- 来源：PLOS ONE 2020
- 过量表达菊花DmDREBa基因提高转化烟草耐低温能力被引量：6收藏
- 作者：杨艳芳[1] 武剑[2] 朱凯[2] 刘黎卿[3] 陈发棣[4]
- 机构：中国林业科学研究院林业研究所;南京农业大学大豆研究所;福建省植物生理生化重点公共实验室;南京农业大学园艺学院观赏园艺系
- 来源：《植物研究》 2016
- 关键词：菊花 DREB 农杆菌转化 转基因烟草 耐逆性
- 摘要：各种环境因素,如干旱、高盐、激素和低/高温等非生物胁迫对植物的生长发育造成很大影响。DREB转录因子在植物抵抗非生物胁迫中起到关键作用。本研究通过根癌农杆菌介导的叶盘转化法将菊花DmD REBa基因导入烟草中并进行了耐低...
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- 红豆杉总RNA提取方法的比较被引量：6收藏
- 作者：张恺恺[1,2] 李清[2] 惠楠[2] 陈段芬[1] 邱德有[2]
- 机构：河北农业大学园艺学院;中国林业科学研究院林业研究所
- 来源：《分子植物育种》 2019
- 关键词：红豆杉(Taxus chinensis) 总RNA 提取方法
- 摘要：为了确立红豆杉总RNA的最适提取方法,本研究以南方红豆杉嫩叶和曼地亚红豆杉愈伤组织为材料,比较了改良十六烷基三甲基溴化铵(Hexadecyl trimethyl ammonium bromide,CTAB)法、试剂盒法和...
- 其他来源数据库：万方期刊数据库同方期刊数据库
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- Comparative Transcriptome Analysis Reveals Stem Secondary Growth of Grafted Rosa rugosa 'Rosea' Scion and R. multiflora 'Innermis' Rootstock被引量：6收藏
- 作者：Sun, Jing-shuang[1] Hu, Rui-yang[1] Lv, Fu-ling[1] Yang, Yan-fang[2] Tang, Zhi-min[1]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry
- 来源：GENES 2020
- 关键词：RNA-sequencing Rosa grafting stem scion rootstock
- 欧洲红豆杉AP2/ERF转录因子基因序列分析被引量：6收藏
- 作者：杨艳芳[1] 刘洪伟[1] 邱德有[1]
- 机构：中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室
- 来源：《氨基酸和生物资源》 2014
- 关键词：红豆杉 AP2 转录因子 生物信息学 紫杉醇
- 摘要：以东北红豆杉AP2转录因子氨基酸序列为查询序列,搜索比对欧洲红豆杉基因组草图数据得到一个AP2转录因子全长序列,并命名为TbAP2。同时,利用生物信息学方法对TbAP2基因序列及其编码蛋白进行了特征分析和功能预测,发现该...
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- Transcriptome analysis identifies novel responses and potential regulatory genes involved in 12-deoxyphorbol-13-phenylacetate biosynthesis of Euphorbia resinifera被引量：5收藏
- 作者：Zhang, Kaikai[1,2] Fan, Wei[3] Huang, Zhongwen[4] Chen, Duanfen[2] Yao, Zhiwang[2]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Agr Univ Hebei;Chinese Acad Forestry;Henan Inst Sci & Technol
- 来源：INDUSTRIAL CROPS AND PRODUCTS 2019
- 关键词：Euphorbia resinifera DPP Transcriptome Casbene synthase Gene expression
- Genome-wide analysis of the terpene synthase gene family in physic nut (Jatropha curcas L.) and functional identification of six terpene synthases被引量：5收藏
- 作者：Xiong, Wangdan[1,2] Wu, Pingzhi[1] Jia, Yongxia[1] Wei, Xiaoyi[1] Xu, Liangxiong[1]
- 机构：Chinese Acad Sci;Univ Chinese Acad Sci;Chinese Acad Forestry
- 来源：TREE GENETICS & GENOMES 2016
- 关键词：Physic nut Terpene synthase Catalytic assay Diterpene Sesquiterpene
- Advances in Biosynthesis and Pharmacological effects of Cinnamomum camphora (L.) Presl Essential Oil被引量：4收藏
- 作者：Du, Yuqing[1] Zhou, Hua[2] Yang, Liying[3] Jiang, Luyuan[1] Chen, Duanfen[4]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Jiangxi Acad Sci;China Flower Assoc;Hebei Agr Univ
- 来源：FORESTS 2022
- 关键词：biosynthesis biological activity Cinnamomum camphora essential oil (CCEO) genes terpenoids
- Genome-Wide Identification of m(6)A Writers, Erasers and Readers in Poplar 84K被引量：3收藏
- 作者：Sun, Xiaochen[1] Wu, Wenli[1] Yang, Yanfang[1] Wilson, Iain[2] Shao, Fenjuan[1]
- 机构：Chinese Acad Forestry;CSIRO Agr & Food
- 来源：GENES 2022
- 关键词：m(6)A modification writers erasers readers LBD 15 poplar 84K
