- Genetic diversity analysis of a breeding population of Eucalyptus cloeziana F. Muell. (Myrtaceae) and extraction of a core germplasm collection using microsatellite markers被引量:26收藏
- 作者:Lv, Jiabin[1,2] Li, Changrong[3,4] Zhou, Changpin[1,2] Chen, Jianbo[3,4] Li, Fagen[1,2]
- 机构:Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry;Guangxi Forestry Res Inst;Guangxi Forestry Res Inst;Yulin Forestry Res Inst
- 来源:INDUSTRIAL CROPS AND PRODUCTS 2020
- 关键词:Eucalyptus cloeziana F. Muell. Breeding population Genetic structure Molecular marker Core collection
- Genetic parameters for growth and wood mechanical properties in Eucalyptus cloeziana F. Muell.被引量:25收藏
- 作者:Li, Changrong[1,2,3,4] Weng, Qijie[2] Chen, Jian-Bo[3,4] Li, Mei[2] Zhou, Changpin[2]
- 机构:Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry;Guangxi Forestry Res Inst;Guangxi Forestry Res Inst;Yulin Forestry Res Inst
- 来源:NEW FORESTS 2017
- 关键词:Heritability Genetic correlation Wood mechanical property Growth Eucalyptus cloeziana
- Development of 240 novel EST-SSRs in Eucalyptus L'Herit被引量:24收藏
- 作者:Zhou, Changpin[1,2] He, Xudong[3] Li, Fagen[2] Weng, Qijie[2] Yu, Xiaoli[2]
- 机构:Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry;Nanjing Forestry Univ
- 来源:MOLECULAR BREEDING 2014
- 关键词:Eucalyptus Expressed sequence tag (EST) Simple sequence repeat (SSR) Polymorphism Transferability
- Genetic parameters for growth and wood chemical properties in Eucalyptus urophylla x E. tereticornis hybrids被引量:20收藏
- 作者:Chen, Shengkan[1,2] Weng, Qijie[2] Li, Fagen[2] Li, Mei[2] Zhou, Changpin[1,2]
- 机构:Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry
- 来源:ANNALS OF FOREST SCIENCE 2018
- 关键词:Eucalyptus hybrid Growth Wood chemical property Heritability Genetic correlation Type-B correlation
- Genome-wide analysis of the MYB gene family in physic nut (Jatropha curcas L.)被引量:19收藏
- 作者:Zhou, Changpin[1,2,3] Chen, Yanbo[1,3] Wu, Zhenying[1,3] Lu, Wenjia[1,3] Han, Jinli[1,3]
- 机构:Chinese Acad Sci;Chinese Acad Forestry;Univ Chinese Acad Sci
- 来源:GENE 2015
- 关键词:MYB gene family Gene evolution Gene expression abiotic stress Physic nut (Jatropha curcas L.)
- Genome scans for divergent selection in natural populations of the widespread hardwood species Eucalyptus grandis (Myrtaceae) using microsatellites被引量:16收藏
- 作者:Song, Zhijiao[1,2,3] Zhang, Miaomiao[2,4] Li, Fagen[2] Weng, Qijie[2] Zhou, Chanpin[2]
- 机构:Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry;Baoshan Univ;South China Agr Univ;Guangdong Acad Forestry
- 来源:SCIENTIFIC REPORTS 2016
- Genotypic Variation and Genotype-by-Environment Interactions in Growth and Wood Properties in a Cloned Eucalyptus urophylla x E. tereticornis Family in Southern China被引量:15收藏
- 作者:Yang, Heyu[1] Weng, Qijie[2] Li, Fagen[3] Zhou, Changpin[3] Li, Mei[3]
- 机构:Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry
- 来源:FOREST SCIENCE 2018
- 关键词:Eucalyptus clonal repeatability genetic correlation clonal stability
- A novel set of 223 EST-SSR markers in Casuarina L. ex Adans.: polymorphisms, cross-species transferability, and utility for commercial clone genotyping被引量:14收藏
- 作者:Xu, Xiuyu[1,2] Zhou, Changpin[3] Zhang, Yong[3] Zhang, Weiqiang[1] Gan, Xianhua[1]
- 机构:Guangdong Acad Forestry;Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry;Guangzhou Geneunion Biotechnol Co Ltd
- 来源:TREE GENETICS & GENOMES 2018
- 关键词:Casuarina Expressed sequence tag (EST) Simple sequence repeat (SSR) Polymorphism Transferability Clone genotyping
- Comparative Genomics Analyses Reveal Extensive Chromosome Colinearity and Novel Quantitative Trait Loci in Eucalyptus被引量:12收藏
- 作者:Li, Fagen[1,2] Zhou, Changpin[2] Weng, Qijie[2] Li, Mei[2] Yu, Xiaoli[2]
- 机构:Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry
- 来源:PLOS ONE 2015
- 细叶桉群体的遗传多样性和受选择位点被引量:8收藏
- 作者:宋志姣[1,2,3] 杨合宇[2] 翁启杰[2] 周长品[2] 李发根[2]
- 机构:林木遗传育种国家重点实验室(中国林业科学研究院);中国林业科学研究院热带林业研究所热带林业研究国家林业局重点实验室;保山学院;国家林业局桉树研究开发中心
- 来源:《林业科学》 2016
- 关键词:细叶桉 SSR标记 遗传多样性 群体结构 适应性
- 摘要:【目的】分析细叶桉天然群体的多样性水平和遗传结构,为种质资源管理和育种利用提供有用信息;检测细叶桉与原产地气候因子显著关联的基因组位点,探索气候适应过程中趋异选择的分子证据。【方法】以细叶桉9个群体的77株样品为材料,基...
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- 尾叶桉×邓恩桉早期生长和耐寒性的遗传分析被引量:6收藏
- 作者:翁启杰[1] 赖秋香[2] 李发根[1] 周长品[1] 李建文[2]
- 机构:中国林业科学研究院热带林业研究所;福建省永安林业(集团)股份有限公司种苗中心
- 来源:《南京林业大学学报:自然科学版》 2015
- 关键词:尾叶桉 邓恩桉 耐寒性 早期生长 遗传参数 杂种优势
- 摘要:为了解尾叶桉×邓恩桉杂种的生长和耐寒性遗传参数,以6株尾叶桉(母本)与7株邓恩桉(父本)杂交的析因交配群体为材料,进行了8月生耐寒性指数(C8)和20月生树高(H20)及胸径(D20)的遗传分析。结果表明:就3个性状表现...
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- The first identification of genomic loci in plants associated with resistance to galling insects: a case study in Eucalyptus L'Her. (Myrtaceae)被引量:6收藏
- 作者:Zhang, Miaomiao[1,2,3] Zhou, Changpin[1,2] Song, Zhijiao[1,2,4] Weng, Qijie[2] Li, Mei[2]
- 机构:Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry;South China Agr Univ;Baoshan Univ;Guangdong Acad Forestry
- 来源:SCIENTIFIC REPORTS 2018
- 桉树扦插生根和生长性状的QTL定位被引量:4收藏
- 作者:于晓丽[1] 李发根[1] 翁启杰[1] 周长品[1] 甘四明[1]
- 机构:中国林业科学研究院热带林业研究所
- 来源:《林业科学研究》 2011
- 关键词:桉树 QTL 扦插生根 生长
- 摘要:本研究以1个尾叶桉×细叶桉F1谱系为材料,在亲本遗传图谱上对扦插穗条的根数、最长根长、生根率和根干质量4个扦插生根性状及13、18、46个月生的树高和胸径2个生长性状的数量性状位点(QTL)进行了定位,结果表明:在母本尾...
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- 大花序桉群体适应性相关的SSR位点被引量:4收藏
- 作者:王莉[1] 李昌荣[2] 李发根[1] 周长品[1] 翁启杰[1]
- 机构:中国林业科学研究院热带林业研究所;广西壮族自治区林业科学研究院;玉林市林业科学研究所
- 来源:《南京林业大学学报:自然科学版》 2019
- 关键词:大花序桉 SSR 标记 气候因子 正向选择 群体适应性 地理隔离
- 摘要:【目的】检测大花序桉群体与环境适应性相关的基因组位点,为种质资源保护和利用提供分子生物学信息。【方法】利用84个SSR标记(包括29个基因组SSR和55个EST-SSR)分析引种到广西,来源于澳大利亚昆土兰州北部和南部各...
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- 尾细桉生长和木材密度关联SNP挖掘与候选基因定位被引量:4收藏
- 作者:朱显亮[1] 周长品[1] 贾翠蓉[1] 翁启杰[1] 李发根[1]
- 机构:中国林业科学研究院热带林业研究所
- 来源:《南京林业大学学报:自然科学版》 2021
- 关键词:尾细桉 测序分型 单核苷酸多态性(SNP) 表型性状 关联分析 候选基因
- 摘要:【目的】生长和木材基本密度是桉树的重要经济性状,挖掘其候选功能基因可为桉树遗传改良提供参考。【方法】以尾叶桉(Eucalyptus urophylla)和细叶桉(Eucalyptustereticornis) F1全同胞...
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- Enhanced correlations of EST-SSR-based genetic distance with hybrid performance, specific hybridizing ability, and heterosis using effect-increasing and effect-decreasing alleles: a case study in Eucalyptus L'Her.被引量:3收藏
- 作者:Chen, Shengkan[1,2,3,4] Zhou, Changpin[1,2] He, Xudong[5] Weng, Qijie[2] Li, Fagen[1,2]
- 机构:Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry;Guangxi Forestry Res Inst;Guangxi Forestry Res Inst;Jiangsu Acad Forestry
- 来源:TREE GENETICS & GENOMES 2020
- 关键词:Eucalyptus EST-SSR Specific hybridizing ability Heterosis Effect-increasing allele Effect-decreasing allele
- 基于SSR标记的古茶树(Camellia sinensis)遗传关系分析被引量:3收藏
- 作者:周长品[1] 甘四明[1] 李发根[1] 翁启杰[1] 张照远[2]
- 机构:中国林业科学研究院热带林业研究所;广西壮族自治区林业科学研究院
- 来源:《分子植物育种》 2020
- 关键词:茶树(Camellia sinensis(L.)O.Kuntze) SSR标记 遗传关系
- 摘要:本研究利用30个SSR标记,结合已有的128个茶树品种指纹,对福建省园岭林场的4株古茶树和1株铁观音进行了遗传关系分析。结果表明,30个SSR标记共产生了124个等位片段,每个标记的等位片段数1~9个;多态性信息量较高,...
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- KingFisher Flex核酸纯化系统上树木叶片DNA的提取方法被引量:3收藏
- 作者:杨合宇[1,2] 李发根[2] 翁启杰[2] 李梅[2] 陈升侃[2]
- 机构:中国林业科学研究院林木遗传育种国家重点实验室;中国林业科学研究院热带林业研究所
- 来源:《分子植物育种》 2017
- 关键词:树木 DNA提取 KingFisher Flex
- 摘要:以桉树4种/杂种的叶片为材料,比较了5种磁珠试剂盒在King Fisher Flex核酸纯化系统上自动提取的DNA得率和纯度,初步选出了2种较好的试剂盒。比较了King Fisher Flex上不同的洗涤速度,最优为Me...
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- High-density genetic linkage mapping reveals low stability of QTLs across environments for economic traits in Eucalyptus被引量:3收藏
- 作者:Zhu, Xianliang[1] Weng, Qijie[1] Bush, David[2] Zhou, Changpin[1] Zhao, Haiwen[1]
- 机构:Chinese Acad Forestry;Commonwealth Sci & Ind Res Org CRISO Australian Tr
- 来源:FRONTIERS IN PLANT SCIENCE 2023
- 关键词:Eucalyptus urophylla x tereticornis stable QTL multi-environment trials candidate genes genotyping by sequencing
- 基于Kingfisher Flex系统树木叶片RNA的提取方法比较及优化被引量:3收藏
- 作者:何佳悦[1,2] 王莉[2] 贾翠蓉[2] 朱显亮[2] 王亚琴[2]
- 机构:中国林业科学研究院;中国林业科学研究院热带林业研究所
- 来源:《分子植物育种》 2020
- 关键词:Kingfisher Flex系统 树木叶片 RNA提取 磁珠法RNA提取试剂盒
- 摘要:随着林木功能基因组学的发展,如何快速高效地提取高质量的核酸变得越来越重要。本研究基于Kingfisher Flex全自动磁珠提取纯化系统,以细叶桉叶片为材料,利用5种磁珠法RNA提取试剂盒(A/B/C/D/E)比较提取R...
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- 大花序桉SSR位点多样性和群体结构分析被引量:3收藏
- 作者:王莉[1,2] 李昌荣[3] 李发根[1,2] 周长品[1,2] 翁启杰[1]
- 机构:中国林业科学研究院热带林业研究所;中国林业科学研究院;广西壮族自治区林业科学研究院;玉林市林业科学研究所
- 来源:《分子植物育种》 2019
- 关键词:大花序桉 SSR 遗传多样性 群体结构
- 摘要:为了获得大花序桉群体变异的可靠信息,本研究基于桉树29个基因组简单序列重复(SSR)标记,筛选了既不偏离哈温平衡、又非群体间分化系数(Fst)离群值的中性SSR用于大花序桉14个群体的遗传多样性和群体结构分析。基于11个...
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- 新形势下林业科技管理创新举措与发展对策——以中国林业科学研究院热带林业研究所为例被引量:2收藏
- 作者:廖超[1] 裴男才[1] 叶天一[1] 周长品[1]
- 机构:中国林业科学研究院热带林业研究所
- 来源:《温带林业研究》 2022
- 关键词:科研管理 科技创新 制度建设 信息化平台
- 摘要:随着新时代社会的发展和信息化进程的加快,信息时代社会背景下的林业必然会推动林业科技管理的创新,同时也对林业科技管理提出了新要求、新目标和新挑战。结合实际工作,做好新形势下林业科技管理工作,为创新科技管理机制,服务国家战略...
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- Predicting genetic response to future climate change in Eucalyptus grandis by combining genomic data with climate models被引量:2收藏
- 作者:Wang, Ping[1] Jia, Cuirong[1] Bush, David[2] Zhou, Changpin[1] Weng, Qijie[1]
- 机构:Chinese Acad Forestry;CSIRO Australian Tree Seed Ctr
- 来源:FOREST ECOLOGY AND MANAGEMENT 2023
- 关键词:Climate change Population genetics Association analysis Forest management ddGBS
- Association of microsatellite markers with growth and wood mechanical traits in Eucalyptus cloeziana F. Muell. (Myrtaceae)被引量:2收藏
- 作者:Zhou, Changpin[1,2] Wang, Li[1,2] Weng, Qijie[2] Li, Fagen[1,2] Li, Mei[2]
- 机构:Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry;Forestry Minist China;Forestry Minist China
- 来源:INDUSTRIAL CROPS AND PRODUCTS 2020
- 关键词:Eucalyptus cloeziana F. Muell Association mapping Growth Wood mechanical property Microsatellite marker
- 细叶桉(Eucalyptustereticornis)早期生长的SSR标记关联分析被引量:2收藏
- 作者:宋志姣[1,2] 翁启杰[2] 周长品[2] 李发根[2] 李梅[2]
- 机构:林木遗传育种国家重点实验室;热带林业研究实验室中国林业科学研究院热带林业研究所;国家林业局桉树研究开发中心
- 来源:《分子植物育种》 2016
- 关键词:细叶桉(Eucalyptus tereticornis) SSR标记 早期生长 关联分析
- 摘要:本研究基于巨桉全基因组的108个SSR标记(44个基因SSRs和64个EST-SSRs),通过对细叶桉9个群体的78株样品的初步关联分析和242株样品的关联验证,利用一般线性模型和混合线性模型共检测到与细叶桉9月生树高(...
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- 基于ddGBS的桉树SNP挖掘和系统进化分析被引量:1收藏
- 作者:贾翠蓉[1,2,3] 朱显亮[1,2,3] 王莉[1,2] 周长品[1,2] 翁启杰[1,2]
- 机构:中国林业科学研究院热带林业研究所;中国林业科学研究院热带林业研究国家林业和草原局重点实验室;南京林业大学林学院
- 来源:《中南林业科技大学学报》 2020
- 关键词:桉树 ddGBS SNP 进化分析
- 摘要:【目的】利用ddGBS技术获得桉树树种间高质量SNP标记,为桉树系统分类提供新思路。【方法】通过对14个桉树树种(每个树种各两份样品)进行ddGBS建库测序分析,发掘SNP位点,开展位点注释及核苷酸多样性分析,并且通过I...
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- 尾叶桉×细叶桉多年生生长及其与材性相关的遗传分析被引量:1收藏
- 作者:邱妍[1,2] 翁启杰[1] 李梅[1] 陈升侃[1,3] 周长品[1]
- 机构:中国林业科学研究院热带林业研究所;南京林业大学;广西壮族自治区林业科学研究院
- 来源:《林业科学研究》 2022
- 关键词:尾叶桉×细叶桉 生长性状 遗传力 遗传相关 材性性状
- 摘要:[目的]了解尾叶桉×细叶桉多年生生长的遗传规律,为大径材良种培育的早期选择年龄的确定提供可靠依据。[方法]对10株尾叶桉×10株细叶桉不完全析因交配产生的59个杂种组合13、16年生树高、胸径和材积采用混合线性模型估算母...
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- Xylem Transcriptome Analysis in Contrasting Wood Phenotypes of Eucalyptus urophylla x tereticornis Hybrids被引量:1收藏
- 作者:Zhu, Xianliang[1] He, Jiayue[1] Zhou, Changpin[1] Weng, Qijie[1] Chen, Shengkan[2,3]
- 机构:Chinese Acad Forestry;Guangxi Forestry Res Inst;Guangxi Forestry Res Inst;CSIRO
- 来源:FORESTS 2022
- 关键词:Eucalyptus RNA splicing transcription factors wood formation differentially expressed gene
- Development of simple sequence repeat (SSR) markers and genetic diversity analysis in black-wood (Acacia melanoxylon) clones in china被引量:1收藏
- 作者:Fan, Chunjie[1] Liu, Qianyu[1] Zeng, Bingshan[1] Qiu, Zhenfei[1] Zhou, Changpin[1]
- 机构:Chinese Acad Forestry
- 来源:SILVAE GENETICA 2016
- 关键词:Acacia melanoxylon SSR genetic diversity polymorphism information content
- 一种基于双酶切的简化基因组测序文库的构建方法被引量:0收藏
- 作者:李发根[1] 甘四明[1] 贾翠蓉[1] 翁启杰[1] 周长品[1]
- 机构:中国林业科学研究院热带林业研究所
- 来源:《CN110343741B》 2023
- 关键词:构建 测序文库 连接产物 基因组 双酶切 引物 限制性内切酶MspI 基因组DNA 测序技术 磁珠分选 接头序列 扩增产物 酶切产物 全基因组 上游引物 下游引物 混合物 酶切 双轮 开发
- 摘要:本发明提供了一种基于双酶切的简化基因组测序文库的构建方法,属于全基因组重测序技术领域,包括利用限制性内切酶MspI和MseI对基因组DNA进行酶切,将接头序列分别连接到酶切产物上,得到连接产物;将连接产物进行等质量混合,...