- Hsf and Hsp gene families in Populus: genome-wide identification, organization and correlated expression during development and in stress responses被引量：174收藏
- 作者：Zhang, Jin[1,2] Liu, Bobin[1,3] Li, Jianbo[1] Zhang, Li[1] Wang, Yan[4]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Nanjing Forestry Univ;Fujian Agr & Forestry Univ;Shandong Agr Univ;McGill Univ
- 来源：BMC GENOMICS 2015
- 关键词：Coexpression Expression analysis Gene family Heat shock factor (Hsf) Heat shock protein (Hsp) Populus
- 随机森林算法基本思想及其在生态学中的应用--以云南松分布模拟为例被引量：131收藏
- 作者：张雷[1] 王琳琳[2] 张旭东[1] 刘世荣[3] 孙鹏森[3]
- 机构：中国林业科学研究院林业研究所、国家林业局林木培育重点实验室;北京林业大学林学院;中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所、国家林业局森林生态环境重点实验室;Department of Forest Sciences
- 来源：《生态学报》 2014
- 关键词：随机森林 分类回归树 变量重要性 多维数据 物种分布模拟
- 摘要：通常来讲,生态学者对于解释生态关系、描述格局和过程、进行空间或时间预测比较感兴趣。这些工作可以通过模拟输出值(响应)与一些特征值(即解释变量)的关系来实现。然而,生态数据模拟遇到了挑战,这是因为响应变量和预测变量可能是连...
- 其他来源数据库：
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- Consensus Forecasting of Species Distributions: The Effects of Niche Model Performance and Niche Properties被引量：83收藏
- 作者：Zhang, Lei[1] Liu, Shirong[2] Sun, Pengsen[2] Wang, Tongli[3] Wang, Guangyu[4]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry;Univ British Columbia;Univ British Columbia;Beijing Agr Univ
- 来源：PLOS ONE 2015
- Genome-wide analysis of the Populus Hsp90 gene family reveals differential expression patterns, localization, and heat stress responses被引量：68收藏
- 作者：Zhang, Jin[1] Li, Jianbo[1] Liu, Bobin[1] Zhang, Li[1] Chen, Jun[1]
- 机构：Chinese Acad Forestry
- 来源：BMC GENOMICS 2013
- 关键词：Expression analysis Gene family Gene structure Hsp90 Phylogenetic analysis Populus
- Where should China practice forestry in a warming world?被引量：64收藏
- 作者：Zhang, Lei[1] Sun, Pengsen[2] Huettmann, Falk[3] Liu, Shirong[2]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry;Univ Alaska Fairbanks UAF
- 来源：GLOBAL CHANGE BIOLOGY 2022
- 关键词：afforestation climate change climax vegetation forestation failure Hu Line range shift reforestation tree planting
- 岷江柏天然种群种实表型变异特征被引量：30收藏
- 作者：冯秋红[1] 史作民[2] 徐峥静茹[1,3] 缪宁[4] 唐敬超[2]
- 机构：四川省林业科学研究院;中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所/国家林业局森林生态环境重点实验室;成都理工大学;四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室;中国林业科学研究院林业研究所
- 来源：《应用生态学报》 2017
- 关键词：种实 表型性状 环境因子 天然种群 岷江柏
- 摘要：运用巢式方差分析、变异系数、表型分化系数和聚类分析等多种分析方法,研究了11个岷江柏种群的13个种实表型性状在种群内和种群间的变异及其与环境因子间的关系,并对其进行了类群划分.结果表明:岷江柏种实表型性状在种群间和种群内...
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- 四川长宁毛竹林碳储量与碳汇能力估测被引量：29收藏
- 作者：张蕊[1] 申贵仓[2] 张旭东[1] 张雷[1] 高升华[1]
- 机构：林木遗传育种国家重点实验室;环境保护部环境规划院
- 来源：《生态学报》 2014
- 关键词：毛竹 碳密度 碳储量 碳汇
- 摘要：利用生物量法研究了四川长宁毛竹林(Phyllostachys edulis)碳密度、碳储量及其空间分配格局,并对毛竹林碳汇能力进行了估算。结果表明:(1)毛竹立竹各器官的平均含碳率波动范围为462.37—480.68 g...
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- Classification and regression with random forests as a standard method for presence-only data SDMs: A future conservation example using China tree species被引量：28收藏
- 作者：Zhang, Lei[1] Huettmann, Falk[2] Liu, Shirong[3] Sun, Pengsen[3] Yu, Zhen[4]
- 机构：Chinese Acad Forestry;UAF;Chinese Acad Forestry;Iowa State Univ Sci & Technol;Chinese Acad Sci
- 来源：ECOLOGICAL INFORMATICS 2019
- 关键词：Species distribution model Binary prediction Numerical prediction Threshold Machine learning Species traits Climate change
- Characterization of the Populus Rab family genes and the function of PtRabE1b in salt tolerance被引量：20收藏
- 作者：Zhang, Jin[1,2] Li, Yu[1] Liu, Bobin[1] Wang, Lijuan[1] Zhang, Li[1]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Oak Ridge Natl Lab;McGill Univ
- 来源：BMC PLANT BIOLOGY 2018
- 关键词：Populus Rab GTPase Phylogenetic analysis Co-expression network Subcellular localization Salt tolerance
- The use of classification and regression algorithms using the random forests method with presence-only data to model species' distribution被引量：20收藏
- 作者：Zhang, Lei[1] Huettmann, Falk[2] Zhang, Xudong[1] Liu, Shirong[3] Sun, Pengsen[3]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Univ Alaska Fairbanks;Chinese Acad Forestry;Iowa State Univ Sci & Technol;Chinese Acad Sci
- 来源：METHODSX 2019
- 关键词：Binary prediction Numerical prediction Threshold Machine learning Species traits Climate change Forestation
- 濒危物种长柄扁桃的潜在分布与保护策略被引量：19收藏
- 作者：褚建民[1] 李毅夫[2] 张雷[1] 李斌[1] 高明远[1]
- 机构：中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室;西南林业大学林学院
- 来源：《生物多样性》 2017
- 关键词：长柄扁桃 潜在分布区 最大熵模型 基于规则集的遗传算法(GARP)模型 物种保护
- 摘要：长柄扁桃(Amygdalus pedunculata)在我国分布于内蒙古和陕西,是一种濒危灌木,其资源现状只有零星的文献记录,这限制了对其资源数量和保护现状的评估。为此,本文通过野外调查来确立其自然分布区范围。我们选择了...
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- Expression and localization of SWEETs in Populus and the effect of SWEET7 overexpression in secondary growth被引量：18收藏
- 作者：Zhang, Li[1,2] Wang, Lijuan[1,3] Zhang, Jin[1,4] Song, Cai[1,5] Li, Yu[1]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Heze Univ;Nanjing Forestry Univ;Zhejiang A&F Univ;Cent South Univ Forestry & Technol
- 来源：TREE PHYSIOLOGY 2021
- 关键词：PagSWEET7 Populus sugar transporter wood formation xylem development
- Insights of Molecular Mechanism of Xylem Development in Five Black Poplar Cultivars被引量：14收藏
- 作者：Zhang, Lei[1] Liu, Bobin[2] Zhang, Jin[3] Hu, Jianjun[1]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Fujian Agr & Forestry Univ;Oak Ridge Natl Lab
- 来源：FRONTIERS IN PLANT SCIENCE 2020
- 关键词：Populus developing xylem transcriptome cell wall transcriptional regulation
- Using DEM to predict Abies faxoniana and Quercus aquifolioides distributions in the upstream catchment basin of the Min River in southwest China被引量：14收藏
- 作者：Zhang, Lei[1] Liu, Shirong[2] Sun, Pengsen[2] Wang, Tongli[3] Wang, Guangyu[4]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry;Univ British Columbia;Univ British Columbia;Beijing Agr Univ
- 来源：ECOLOGICAL INDICATORS 2016
- 关键词：Digital elevation model Species distribution model Topographical variable Spatial resolution Forestation
- 蜀南苦竹林生态系统碳储量与碳汇能力估测被引量：13收藏
- 作者：申贵仓[1] 张旭东[1] 张雷[1] 高升华[1] 张蕊[1]
- 机构：林木遗传育种国家重点实验、室中国林业科学研究院林业研究所;四川省长宁县林业局
- 来源：《林业科学》 2013
- 关键词：苦竹 碳储量 碳密度 碳汇
- 摘要：科学准确的碳计量是评价森林减缓大气CO2浓度增加、应对气候变化能力的关键,而竹林特殊的生物学与生态学特性使得竹林碳汇计量较其他森林生态系统更为复杂。采用生物量法研究蜀南苦竹林生态系统的碳密度、碳储量及其空间分配格局,并对...
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- Comparative Transcriptome Analysis Revealed Candidate Genes Potentially Related to Desiccation Sensitivity of Recalcitrant Quercus variabilis Seeds被引量：10收藏
- 作者：Li, Dongxing[1] Li, Yingchao[1] Qian, Jialian[1] Liu, Xiaojuan[1] Xu, Huihui[1]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Hongya Mt State Owned Forest Farm Hebei;Zhejiang Agr & Forestry Univ;Zhejiang Agr & Forestry Univ
- 来源：FRONTIERS IN PLANT SCIENCE 2021
- 关键词：Quercus variabilis recalcitrant seeds desiccation sensitivity transcriptome differentially expressed genes plant hormone signaling
- Agronomic performance of 27 Populus clones evaluated after two 3-year coppice rotations in Henan, China被引量：10收藏
- 作者：Zhang, Jin[1,2] Song, Xueqin[1] Zhang, Lei[1] Jia, Huixia[1] Peng, Xiaopeng[1]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Oak Ridge Natl Lab;Jiaozuo Acad Agr & Forestry Sci
- 来源：GLOBAL CHANGE BIOLOGY BIOENERGY 2020
- 关键词：biofuels biomass cell wall field trial growth integrated regulatory network Populus short-rotation coppice yield
- 极小种群野生植物梓叶槭的种实表型变异特征被引量：8收藏
- 作者：冯秋红[1,2] 李登峰[1,4] 于涛[3] 李俊清[3] 马文宝[1,2]
- 机构：四川省林业科学研究院;森林和湿地生态恢复与保育四川重点实验室;北京林业大学省部共建森林培育与保护教育部重点实验室;四川农业大学;国家林业和草原局森林培育重点实验室
- 来源：《生物多样性》 2020
- 关键词：梓叶槭 种子 翅果 表型性状 气象因子 极小种群
- 摘要：表型变异是植物遗传变异与环境异质性相互作用的结果,是植物适应和进化的具体表现。为揭示极小种群植物梓叶槭(Acer catalpifolium)的种实表型在其适应环境过程中的变异特征,明确梓叶槭优质种源地,为该物种的保护提...
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- Genome-Wide Identification of Long Non-Coding RNAs and Their Potential Functions in Poplar Growth and Phenylalanine Biosynthesis被引量：8收藏
- 作者：Zhang, Lei[1] Ge, Xiaolan[1] Du, Jiujun[1] Cheng, Xingqi[1] Peng, Xiaopeng[1]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Nanjing Forestry Univ
- 来源：FRONTIERS IN GENETICS 2021
- 关键词：lncRNA-mRNA poplar phenylalanine biosynthesis xylem hormone
- 滩地美洲黑杨人工林皆伐对地表甲烷通量的短期影响被引量：7收藏
- 作者：高升华[1] 张旭东[1] 汤玉喜[2] 张蕊[1] 唐洁[2]
- 机构：中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室;湖南省林业科学院
- 来源：《林业科学》 2013
- 关键词：甲烷通量 皆伐 美洲黑杨人工林 快速甲烷分析仪 静态箱 长江滩地
- 摘要：2011年4—7月,利用静态箱-快速甲烷分析仪(FMA)法,在岳阳市君山区长江外滩美洲黑杨人工成熟林对比观测皆伐区和未采伐区地表甲烷通量,结合同步观测的土壤温度、湿度和植被结构因子,分析皆伐对试验区地表甲烷汇功能影响的原...
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- 生境概率预测值转换为二元值过程中4个阈值选择方法的比较评估--以珙桐和杉木生境预估为例被引量：7收藏
- 作者：张雷[1] 王琳琳[2] 刘世荣[3] 孙鹏森[3] 余振[4]
- 机构：中国林业科学研究院林业研究所;北京农学院;中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所;School of Natural Resources;山东省枣庄市市中区林业局
- 来源：《植物生态学报》 2017
- 关键词：阈值 概率生境图 二元生境图 随机森林 珙桐 杉木
- 摘要：物种生境模型预测结果通常是概率性的,然而在具体的保护管理等实践应用过程中通常需要基于二元值(存在/不存在)的分布图,此时就需要把概率性的预测结果转化为二元值,在此转化过程中就涉及阈值选择问题。此外,在评估模型预测准确度的...
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- Response of Functional Diversity of Soil Microbial Community to Forest Cutting and Regeneration Methodology in a Chinese Fir Plantation被引量：6收藏
- 作者：Wang, Xu[1] Gao, Shenghua[1] Chen, Jiquan[2] Yao, Zengwang[1] Zhang, Lei[1]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Michigan State Univ
- 来源：FORESTS 2022
- 关键词：Chinese fir plantation harvest residues microbial functional diversity soil nutrients biolog microplate technology
- Genetic architecture of leaf morphological and physiological traits in a Populus deltoides 'Danhong' x P. simonii 'Tongliao1' pedigree revealed by quantitative trait locus analysis被引量：6收藏
- 作者：Sun, Pei[1] Jia, Huixia[1] Cheng, Xingqi[1] Zhang, Yahong[1] Li, Jianbo[2]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry;Oak Ridge Natl Lab
- 来源：TREE GENETICS & GENOMES 2020
- 关键词：Populus Whole genome re-sequencing Linkage map Leaf morphological and physiological traits Quantitative trait locus Co-expression
- Soil Properties Interacting With Microbial Metagenome in Decreasing CH4 Emission From Seasonally Flooded Marshland Following Different Stages of Afforestation被引量：4收藏
- 作者：Zhang, Qian[1] Tang, Jie[2] Angel, Roey[3] Wang, Dong[4] Hu, Xingyi[5]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Hunan Acad Forestry;Czech Acad Sci;Chinese Acad Forestry;Hubei Acad Forestry
- 来源：FRONTIERS IN MICROBIOLOGY 2022
- 关键词：CH4 flux soil metagenome methanogens methanotrophs soil particle size composition
- QTL mapping of drought-related traits in the hybrids of Populus deltoides 'Danhong' x Populus simonii 'Tongliao1'被引量：4收藏
- 作者：Du, Changjian[1,2] Sun, Pei[1,3] Cheng, Xingqi[1,2] Zhang, Lei[1,2] Wang, Lijuan[1,2]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Nanjing Forestry Univ;Beijing Acad Agr & Forestry Sci
- 来源：BMC PLANT BIOLOGY 2022
- 关键词：Drought stress QTL mapping Crossbreeding Populus Coexpression network Drought-related traits
- An integrated metabolome and transcriptome approach reveals the fruit flavor and regulatory network during jujube fruit development被引量：4收藏
- 作者：Lu, Dongye[1] Zhang, Lei[2] Wu, Yang[1] Pan, Qinghua[1] Zhang, Yuping[1]
- 机构：Beijing Acad Agr & Forestry Sci;Chinese Acad Forestry;Hebei Agr Univ
- 来源：FRONTIERS IN PLANT SCIENCE 2022
- 关键词：Ziziphus jujuba metabolome transcriptome fruit quality regulatory network
- Insight into growth and wood properties based on QTL and eQTL mapping in Populus deltoides 'Danhong' x Populus simonii 'Tongliao1'被引量：1收藏
- 作者：Zhang, Lei[1,2] Lu, Dongye[3] Ge, Xiaolan[1] Du, Jiujun[1] Wen, Shuangshuang[1]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Nanjing Forestry Univ;Beijing Acad Agr & Forestry Sci
- 来源：INDUSTRIAL CROPS AND PRODUCTS 2023
- 关键词：Populus QTL eQTL Xylem development Co-expression network Calmodulin
- PeCLH2 Gene Positively Regulate Salt Tolerance in Transgenic Populus alba x Populus glandulosa被引量：1收藏
- 作者：Ge, Xiaolan[1,2] Du, Jiujun[1] Zhang, Lei[1,3] Qu, Guanzheng[2] Hu, Jianjun[1,3]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Northeast Forestry Univ;Nanjing Forestry Univ
- 来源：GENES 2023
- 关键词：Populus euphratica PeCLH2 salt stress physiologic indexes transcriptome
- Genome-Wide Analysis of the AAAP Gene Family in Populus and Functional Analysis of PsAAAP21 in Root Growth and Amino Acid Transport被引量：1收藏
- 作者：Du, Jiujun[1] Du, Changjian[1] Ge, Xiaolan[1] Wen, Shuangshuang[1] Zhou, Xinglu[1]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Nanjing Forestry Univ
- 来源：INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES 2023
- 关键词：Populus PtrAAAPs adventitious root amino acid transport QTL
- Combining GS-assisted GWAS and transcriptome analysis to mine candidate genes for nitrogen utilization efficiency in Populus cathayana被引量：1收藏
- 作者：Zhou, Xinglu[1] Xiang, Xiaodong[1] Zhang, Min[1] Cao, Demei[1] Du, Changjian[1]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Nanjing Forestry Univ
- 来源：BMC PLANT BIOLOGY 2023
- 关键词：Populus cathayana GWAS GS RNA-seq Nitrogen use efficiency
