成果/Result
- An efficient approach to finding Siraitia grosvenorii triterpene biosynthetic genes by RNA-seq and digital gene expression analysis被引量：140收藏
- 作者：Tang, Qi[1,3] Ma, Xiaojun[1,3] Mo, Changming[3] Wilson, Iain W.[4] Song, Cai[3]
- 机构：Chinese Acad Med Sci;Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Med Sci;CSIRO Plant Ind
- 来源：BMC GENOMICS 2011
- Genome sequencing and analysis of the paclitaxel-producing endophytic fungus Penicillium aurantiogriseum NRRL 62431被引量：108收藏
- 作者：Yang, Yanfang[1] Zhao, Hainan[2] Barrero, Roberto A.[3] Zhang, Baohong[4] Sun, Guiling[5,6]
- 机构：Chinese Acad Forestry;China Agr Univ;Murdoch Univ;E Carolina Univ;Southwest Forestry Univ
- 来源：BMC GENOMICS 2014
- 关键词：Penicillium aurantiogriseum NRRL 62431 Paclitaxel Taxol (TM) Endophytic fungi Genome sequence Horizontal gene transfer
- High throughput sequencing technology reveals that the taxoid elicitor methyl jasmonate regulates microRNA expression in Chinese yew (Taxus chinensis)被引量：106收藏
- 作者：Qiu, Deyou[1] Pan, Xiaoping[2] Wilson, Iain W.[3] Li, Fenglan[1,4,5] Liu, Min[1]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Western Illinois Univ;CSIRO Plant Ind;Chinese Acad Med Sci;Peking Union Med Univ
- 来源：GENE 2009
- 关键词：MicroRNA Taxus chinensis Illumina sequencing Methyl jasmonate Paclitaxel biosynthesis
- De novo sequencing and a comprehensive analysis of purple sweet potato (Impomoea batatas L.) transcriptome被引量：104收藏
- 作者：Xie, Fuliang[1] Burklew, Caitlin E.[1] Yang, Yanfang[2,3] Liu, Min[4] Xiao, Peng[5]
- 机构：E Carolina Univ;Chinese Acad Forestry;State Key Lab Tree Genet & Breeding;China Agr Univ;E Carolina Univ
- 来源：PLANTA 2012
- 关键词：Anthocyanin Gene expression Microsatellite markers RNA-sequencing Simple sequence repeat (SSR) Sweet potato Transcriptome
- 茉莉酸甲酯对丹参毛状根中丹参酮类成分积累和释放的影响被引量：94收藏
- 作者：王学勇[1] 崔光红[1] 黄璐琦[1] 邱德有[2]
- 机构：中国中医科学院中药研究所;中国林业科学研究院林业研究所
- 来源：《中国中药杂志》 2007
- 关键词：茉莉酸甲酯 丹参 毛状根 HPLC
- 摘要：目的:研究茉莉酸甲酯(methy jasmonat,M J)对丹参酮类成分的积累和向培养基中的释放的影响。方法:6-7V悬浮振荡培养ATCC15834农杆菌诱导的丹参毛状根培养18d后,液体培养基中加入化学诱导子——茉莉...
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- The genome of Populus alba x Populus tremula var. glandulosa clone 84K被引量：69收藏
- 作者：Qiu, Deyou[1] Bai, Shenglong[2] Ma, Jianchao[2] Zhang, Lisha[1] Shao, Fenjuan[1]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Henan Univ;Agr Univ Hebei;Univ Arizona;Univ Arizona
- 来源：DNA RESEARCH 2019
- 关键词：poplar 84K genome sequencing subgenome assignment P. alba P. tremula
- De novo transcriptome sequencing and digital gene expression analysis predict biosynthetic pathway of rhynchophylline and isorhynchophylline from Uncaria rhynchophylla, a non-model plant with potent anti-alzheimer's properties被引量：62收藏
- 作者：Guo, Qianqian[1,2] Ma, Xiaojun[3,4] Wei, Shugen[5] Qiu, Deyou[6] Wilson, Iain W.[7]
- 机构：Northeast Agr Univ;Qiqihar Univ;Chinese Acad Med Sci;Chinese Acad Med Sci;Guangxi Med Bot Garden
- 来源：BMC GENOMICS 2014
- 关键词：Transcriptome DGE Uncaria rhynchophylla Rhynchophylline Isorhynchophylline Terpene indole alkaloid biosynthesis
- De novo assembly of Euphorbia fischeriana root transcriptome identifies prostratin pathway related genes被引量：61收藏
- 作者：Barrero, Roberto A.[1] Chapman, Brett[1] Yang, Yanfang[2] Moolhuijzen, Paula[1] Keeble-Gagnere, Gabriel[1]
- 机构：Murdoch Univ;Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Med Sci
- 来源：BMC GENOMICS 2011
- Genomewide analysis of the lateral organ boundaries domain gene family in Eucalyptus grandis reveals members that differentially impact secondary growth被引量：50收藏
- 作者：Lu, Qiang[1] Shao, Fenjuan[1] Macmillan, Colleen[2] Wilson, Iain W.[2] van der Merwe, Karen[3]
- 机构：Chinese Acad Forestry;CSIRO Agr & Food;Univ Pretoria;China Agr Univ;China Agr Univ
- 来源：PLANT BIOTECHNOLOGY JOURNAL 2018
- 关键词：Eucalyptus grandis lateral organ boundaries domain gene expression secondary growth xylem development fibre production
- 代谢组学研究——功能基因组学研究的重要组成部分被引量：44收藏
- 作者：邱德有[1] 黄璐琦[2]
- 机构：中国林业科学研究院林业研究所;中国中医研究院中药研究所
- 来源：《分子植物育种》 2004
- 关键词：代谢 代谢组 代谢组学 功能基因组学 系统生物学 基因组学 转录组学 蛋白质组学 研究技术 发展趋势
- 摘要：代谢组学 (metabolomics)是上世纪 90年代中期发展起来的一门对某一生物或细胞所有低分子量代谢产物进行定性和定量分析的一门新学科。本文对代谢组和代谢组学的含义、代谢组学与其它组学的区别和关系、代谢组学研究的历...
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- Identification and characterization of MYC transcription factors in Taxus sp.被引量：41收藏
- 作者：Yang Yanfang[1] Zhang Kaikai[1,2] Yang Liying[2] Lv Xing[2] Wu Ying[2]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Agr Univ Hebei;Hebei Acad Sci;Peking Univ
- 来源：GENE 2018
- 关键词：Transcription factor MYC G-box bHLH Taxol Taxus sp.
- 丹参毛状根生物反应器大规模培养的研究被引量：41收藏
- 作者：邱德有[1] 宋经元[2] 马小军[2] 祁建军[2] 张荫麟[2]
- 机构：中国林业科学研究院林业研究所;中国医学科学院协和医科大学药用植物研究所
- 来源：《分子植物育种》 2004
- 关键词：丹参 毛状根 生物反应器 培养规模
- 摘要：以总丹参酮(脂溶性成分)的含量为监测对象,利用10L的球状气升式反应器进行了丹参毛状根培养的初级放大试验, 发现球状气升式反应器培养50d时丹参毛状根的增殖倍数为241.71倍,高于三角瓶摇瓶培养的丹参毛状根的增殖倍数,...
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- The Research Progress of Taxol in Taxus被引量：33收藏
- 作者：Shao, Fenjuan[1] Wilson, Iain W.[2] Qiu, Deyou[1]
- 机构：Chinese Acad Forestry;CSIRO Agr & Food
- 来源：CURRENT PHARMACEUTICAL BIOTECHNOLOGY 2021
- 关键词：Taxus taxol content biosynthesis production endophytic fungi multi-omics
- Identification of novel and conserved microRNAs in Panax notoginseng roots by high-throughput sequencing被引量：33收藏
- 作者：Wei, Rongchang[1,2,3] Qiu, Deyou[6] Wilson, Iain W.[7] Zhao, Huan[1,2] Lu, Shanfa[1,2]
- 机构：Chinese Acad Med Sci;Peking Union Med Coll;Guangxi Bot Garden Med Plants;Hunan Agr Univ;Hunan Agr Univ
- 来源：BMC GENOMICS 2015
- 关键词：Panax notoginseng MicroRNA High-throughput sequencing qRT-PCR Saponins
- Genome-wide identification and characterization of the SPL gene family in Ziziphus jujuba被引量：31收藏
- 作者：Shao, Fenjuan[1] Lu, Qiang[1] Wilson, Iain W.[2] Qiu, Deyou[1]
- 机构：Chinese Acad Forestry;CSIRO Agr & Food
- 来源：GENE 2017
- 关键词：SPL witches'-broom disease Ziziphus jujuba
- 红豆杉器官、组织、细胞培养和基因工程的研究进展被引量：30收藏
- 作者：邱德有[1] 韩一凡[1]
- 机构：中国林业科学研究院林业研究所
- 来源：《天然产物研究与开发》 1998
- 关键词：红豆杉 紫杉醇 器官 组织和细胞培养 基因工程
- 摘要：本文综述了红豆杉器官、组织、细胞培养和基因工程的研究文献,并对这些领域存在的问题及其发展前景进行了讨论。
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- Deep Sequencing Reveals Transcriptome Re-Programming of Taxus x media Cells to the Elicitation with Methyl Jasmonate被引量：29收藏
- 作者：Sun, Guiling[1] Yang, Yanfang[2] Xie, Fuliang[3] Wen, Jian-Fan[4] Wu, Jianqiang[1]
- 机构：Chinese Acad Sci;Chinese Acad Forestry;E Carolina Univ;Chinese Acad Sci;CSIRO Plant Ind
- 来源：PLOS ONE 2013
- LC-MS method for detecting prostratin in plant extracts and identification of a high-yielding population of Euphorbia fischeriana被引量：24收藏
- 作者：Tang, Qi[7] Su, Zhiheng[6] Han, Zhentai[5] Ma, Xiaojun[7] Xu, Derong[4]
- 机构：Univ Portland;Tonghua Normal Univ;Daxinganling Forest Grp Co Ltd;Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry
- 来源：PHYTOCHEMISTRY LETTERS 2012
- 关键词：Euphorbia fischeriana Steud. Euphorbiaceae LC-MS Prostratin 12-Deoxyphorbal-13-acetate
- 树木木质素含量的遗传变异研究进展被引量：24收藏
- 作者：胡新生[1] 韩一凡[1] 邱德有[1]
- 机构：中国林业科学研究院林业研究所
- 来源：《林业科学研究》 1999
- 关键词：树木 木质素含量 遗传变异 基因工程
- 摘要：针对木质素含量这一数量性状的遗传变异规律进行了综合评述。木质素含量在种、群体、个体等不同层次上均表现出复杂的变异模式，环境因素有着不同程度的影响。木质素的合成途径有可能存在多条途径的替换或切换，然而利用基因工程技术对某些...
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- A comparative metabolomics analysis of the components of heartwood and sapwood in Taxus chinensis (Pilger) Rehd.被引量：23收藏
- 作者：Shao, Fenjuan[1] Zhang, Lisha[1] Guo, Juan[2] Liu, Xiaochun[3] Ma, Wenhui[4]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry;Gansu Forestry & Grassland Adm;Liangdang Forestry Adm;CSIRO Agr & Food
- 来源：SCIENTIFIC REPORTS 2019
- Transcriptome-wide analysis of AP2/ERF transcription factors involved in regulating Taxol biosynthesis in Taxus x media被引量：22收藏
- 作者：Zhang, Kaikai[1,2] Jiang, Luyuan[1,2] Wang, Xu[3] Han, Hua[4] Chen, Duanfen[2]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Hebei Agr Univ;Hebei Normal Univ Sci & Technol;Chinese Acad Forestry
- 来源：INDUSTRIAL CROPS AND PRODUCTS 2021
- 关键词：Taxus B5 subgroup Gene expression Bioinformatic analysis Taxol
- Synthesis of Water Soluble Quantum Dots for Monitoring Carrier-DNA Nanoparticles in Plant Cells被引量：21收藏
- 作者：Wang, Qiong[1] Chen, Jienan[1,2] Zhang, Huaiyun[1] Lu, Mengzhu[3] Qiu, Deyou[3]
- 机构：Cent S Univ Forestry & Technol;Transpoints Inc;Chinese Acad Forestry
- 来源：JOURNAL OF NANOSCIENCE AND NANOTECHNOLOGY 2011
- 关键词：Quantum Dot L-Cysteine Bio-Labels Nano-Scale Carriers Jatropha Curcas
- Comparative analysis of the Dicer-like gene family reveals loss of miR162 target site in SmDCL1 from Salvia miltiorrhiza被引量：21收藏
- 作者：Shao, Fenjuan[1,2,3] Qiu, Deyou[3] Lu, Shanfa[1,2]
- 机构：Chinese Acad Med Sci;Peking Union Med Coll;Chinese Acad Forestry
- 来源：SCIENTIFIC REPORTS 2015
- 诱导子对丹参毛状根中丹参酮类成分积累影响被引量：20收藏
- 作者：王学勇[1] 崔光红[1] 黄璐琦[1] 邱德有[2]
- 机构：中国中医科学院中药研究所;中国林业科学研究院林业研究所
- 来源：《中国中药杂志》 2007
- 关键词：丹参毛状根 丹参酮类 活性成分 诱导子 唇形科鼠尾草属植物 次生代谢物 Salvia 繁殖能力
- 其他来源数据库：万方期刊数据库同方期刊数据库
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- Genome-Wide Identification and Analysis of MicroRNAs Involved in Witches'-Broom Phytoplasma Response in Ziziphus jujuba被引量：18收藏
- 作者：Shao, Fenjuan[1] Zhang, Qian[1] Liu, Hongwei[1] Lu, Shanfa[2,3] Qiu, Deyou[1]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Med Sci;Peking Union Med Coll
- 来源：PLOS ONE 2016
- Molecular cloning and characterization of a cytochrome P450 taxoid 9a-hydroxylase in Ginkgo biloba cells被引量：18收藏
- 作者：Zhang, Nan[1] Han, Zhentai[2] Sun, Guiling[3] Hoffman, Angela[4] Wilson, Iain W.[5]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Forestry;Chinese Acad Sci;Univ Portland;CSIRO Plant Ind
- 来源：BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 2014
- 关键词：Taxol Taxoid 9 alpha-hydroxylase Ginkgo biloba CYP450 Cell-free protein synthesis system LC-MS
- Transcriptomic Analysis of Betula halophila in Response to Salt Stress被引量：17收藏
- 作者：Shao, Fenjuan[1] Zhang, Lisha[1] Wilson, Iain W.[2] Qiu, Deyou[1]
- 机构：Chinese Acad Forestry;CSIRO Agr & Food
- 来源：INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES 2018
- 关键词：Betula halophile salt stress transcriptomes
- Selection and validation of reference genes for quantitative gene expression normalization in Taxus spp.被引量：16收藏
- 作者：Zhang, Kaikai[1,2] Fan, Wei[3] Chen, Duanfen[2] Jiang, Luyuan[1,2] Li, Yunfeng[4]
- 机构：Chinese Acad Forestry;Agr Univ Hebei;Chinese Acad Forestry;South China Agr Univ
- 来源：SCIENTIFIC REPORTS 2020
- 红豆杉属植物中紫杉烷化合物含量比较与分析被引量：16收藏
- 作者：吴长桥[1,2] 蒋路园[1,3] 杨艳芳[1] 陆英[2] 唐其[2]
- 机构：中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室;湖南农业大学园艺学院;河北农业大学园艺学院
- 来源：《中草药》 2021
- 关键词：紫杉醇 巴卡亭Ⅲ 10-去乙酰基巴卡亭Ⅲ 10-去乙酰基紫杉醇 三尖杉宁碱 10-去乙酰基-7-木糖基紫杉醇 中国红豆杉 东北红豆杉 云南红豆杉 西藏红豆杉 南方红豆杉 曼地亚红豆杉
- 摘要：目的分析和比较5种红豆杉中6种紫杉烷类化合物含量的差异。方法利用乙醇超声浸提后得到样品溶液;通过高效液相色谱法测定和相关性分析、回归分析和聚类分析比较紫杉醇、巴卡亭Ⅲ、10-去乙酰基巴卡亭Ⅲ(10-deacetylbac...
- 其他来源数据库：万方期刊数据库同方期刊数据库
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- 银杏细胞转录组高通量测序及分析被引量：15收藏
- 作者：张楠[1] 孙桂玲[2] 戴均贵[3] 杨艳芳[1] 刘洪伟[1]
- 机构：中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室;中国科学院昆明植物研究所资源植物与生物技术重点实验室;中国医学科学院/北京协和医学院药物研究所天然药物活性物质与功能国家重点实验室
- 来源：《中国生物工程杂志》 2013
- 关键词：银杏细胞 Genome Analyzer IIx 转录组
- 摘要：利用Illumina的Genome Analyzer IIx对银杏(Ginkgo Biloba)细胞转录组进行高通量测序,挖掘银杏内酯和紫杉醇生物合成基因,特别是新的羟基化酶基因,为今后最终完善红豆杉细胞紫杉醇生物合成途...
- 其他来源数据库：万方期刊数据库同方期刊数据库
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